Protein–RNA interactions for Protein: P38871

SSP1, Sporulation-specific protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP1P38871 YJR018WYJR018W 363 nt14□□□□□ -0.17
SSP1P38871 SHU1YHL006C 453 nt13.99□□□□□ -0.17
SSP1P38871 PAB1YER165W 1734 nt13.91□□□□□ -0.18
SSP1P38871 YNR068CYNR068C 819 nt13.91□□□□□ -0.18
SSP1P38871 YPL041CYPL041C 624 nt13.88□□□□□ -0.19
SSP1P38871 SPT5YML010W 3192 nt13.88□□□□□ -0.19
SSP1P38871 NAB2YGL122C 1578 nt13.88□□□□□ -0.19
SSP1P38871 FTH1YBR207W 1398 nt13.85□□□□□ -0.19
SSP1P38871 COG1YGL223C 1254 nt13.84□□□□□ -0.19
SSP1P38871 YPL168WYPL168W 1293 nt13.77□□□□□ -0.21
SSP1P38871 YJR120WYJR120W 351 nt13.76□□□□□ -0.21
SSP1P38871 URE2YNL229C 1065 nt13.76□□□□□ -0.21
SSP1P38871 YJL107CYJL107C 1164 nt13.75□□□□□ -0.21
SSP1P38871 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.72□□□□□ -0.21
SSP1P38871 RPP2BYDR382W 333 nt13.7□□□□□ -0.22
SSP1P38871 STB1YNL309W 1263 nt13.69□□□□□ -0.22
SSP1P38871 SRB2YHR041C 633 nt13.67□□□□□ -0.22
SSP1P38871 FIS1YIL065C 468 nt13.66□□□□□ -0.22
SSP1P38871 THP3YPR045C 1413 nt13.65□□□□□ -0.22
SSP1P38871 RSM23YGL129C 1353 nt13.63□□□□□ -0.23
SSP1P38871 DAL1YIR027C 1383 nt13.63□□□□□ -0.23
SSP1P38871 BNS1YGR230W 414 nt13.58□□□□□ -0.24
SSP1P38871 YGR021WYGR021W 873 nt13.57□□□□□ -0.24
SSP1P38871 YTH1YPR107C 627 nt13.57□□□□□ -0.24
SSP1P38871 INM2YDR287W 879 nt13.55□□□□□ -0.24
SSP1P38871 WWM1YFL010C 636 nt13.54□□□□□ -0.24
SSP1P38871 FPR4YLR449W 1179 nt13.54□□□□□ -0.24
SSP1P38871 YEL074WYEL074W 339 nt13.53□□□□□ -0.24
SSP1P38871 PHO4YFR034C 939 nt13.51□□□□□ -0.25
SSP1P38871 YOR139CYOR139C 393 nt13.51□□□□□ -0.25
SSP1P38871 FTR1YER145C 1215 nt13.5□□□□□ -0.25
SSP1P38871 SSA4YER103W 1929 nt13.5□□□□□ -0.25
SSP1P38871 YGL118CYGL118C 438 nt13.49□□□□□ -0.25
SSP1P38871 HOM6YJR139C 1080 nt13.48□□□□□ -0.25
SSP1P38871 AST1YBL069W 1290 nt13.48□□□□□ -0.25
SSP1P38871 LSM12YHR121W 564 nt13.45□□□□□ -0.26
SSP1P38871 NPL3YDR432W 1245 nt13.44□□□□□ -0.26
SSP1P38871 REC114YMR133W 1287 nt13.44□□□□□ -0.26
SSP1P38871 FPS1YLL043W 2010 nt13.42□□□□□ -0.26
SSP1P38871 MNP1YGL068W 585 nt13.42□□□□□ -0.26
SSP1P38871 MEP2YNL142W 1500 nt13.41□□□□□ -0.26
SSP1P38871 BDH2YAL061W 1254 nt13.41□□□□□ -0.26
SSP1P38871 MOD5YOR274W 1287 nt13.4□□□□□ -0.26
SSP1P38871 PUS5YLR165C 765 nt13.38□□□□□ -0.27
SSP1P38871 HOS2YGL194C 1359 nt13.37□□□□□ -0.27
SSP1P38871 YPS1YLR120C 1710 nt13.37□□□□□ -0.27
SSP1P38871 PIC2YER053C 903 nt13.37□□□□□ -0.27
SSP1P38871 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.36□□□□□ -0.27
SSP1P38871 Q0142Q0142 177 nt13.36□□□□□ -0.27
SSP1P38871 ATG17YLR423C 1254 nt13.35□□□□□ -0.27
SSP1P38871 YBL100CYBL100C 315 nt13.35□□□□□ -0.27
SSP1P38871 FHN1YGR131W 525 nt13.31□□□□□ -0.28
SSP1P38871 YOL037CYOL037C 354 nt13.31□□□□□ -0.28
SSP1P38871 NAT5YOR253W 531 nt13.31□□□□□ -0.28
SSP1P38871 YHP1YDR451C 1062 nt13.3□□□□□ -0.28
SSP1P38871 RKM5YLR137W 1104 nt13.29□□□□□ -0.28
SSP1P38871 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt13.28□□□□□ -0.28
SSP1P38871 MPC1YGL080W 393 nt13.27□□□□□ -0.29
SSP1P38871 FAF1YIL019W 1041 nt13.27□□□□□ -0.29
SSP1P38871 AIR1YIL079C 1083 nt13.27□□□□□ -0.29
SSP1P38871 LSM3YLR438C-A 270 nt13.27□□□□□ -0.29
SSP1P38871 YBL081WYBL081W 1107 nt13.25□□□□□ -0.29
SSP1P38871 YDR095CYDR095C 411 nt13.24□□□□□ -0.29
SSP1P38871 KTR3YBR205W 1215 nt13.24□□□□□ -0.29
SSP1P38871 Q0255Q0255 1419 nt13.23□□□□□ -0.29
SSP1P38871 APM1YPL259C 1428 nt13.22□□□□□ -0.29
SSP1P38871 NEM1YHR004C 1341 nt13.22□□□□□ -0.29
SSP1P38871 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.21□□□□□ -0.29
SSP1P38871 ICE2YIL090W 1476 nt13.21□□□□□ -0.3
SSP1P38871 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt13.2□□□□□ -0.3
SSP1P38871 FUN26YAL022C 1554 nt13.2□□□□□ -0.3
SSP1P38871 DCW1YKL046C 1350 nt13.19□□□□□ -0.3
SSP1P38871 YGL188CYGL188C 174 nt13.16□□□□□ -0.3
SSP1P38871 YLR036CYLR036C 612 nt13.16□□□□□ -0.3
SSP1P38871 YMR147WYMR147W 672 nt13.16□□□□□ -0.3
SSP1P38871 BNA3YJL060W 1335 nt13.15□□□□□ -0.3
SSP1P38871 TRM9YML014W 840 nt13.15□□□□□ -0.3
SSP1P38871 AIM41YOR215C 558 nt13.15□□□□□ -0.3
SSP1P38871 ATP6Q0085 780 nt13.14□□□□□ -0.31
SSP1P38871 STD1YOR047C 1335 nt13.13□□□□□ -0.31
SSP1P38871 YML079WYML079W 606 nt13.13□□□□□ -0.31
SSP1P38871 COX16YJL003W 357 nt13.11□□□□□ -0.31
SSP1P38871 YNL234WYNL234W 1281 nt13.11□□□□□ -0.31
SSP1P38871 YOR169CYOR169C 465 nt13.11□□□□□ -0.31
SSP1P38871 MRPL36YBR122C 534 nt13.11□□□□□ -0.31
SSP1P38871 SCO2YBR024W 906 nt13.07□□□□□ -0.32
SSP1P38871 KDX1YKL161C 1302 nt13.06□□□□□ -0.32
SSP1P38871 ALF1YNL148C 765 nt13.04□□□□□ -0.32
SSP1P38871 FRE6YLL051C 2139 nt13.03□□□□□ -0.32
SSP1P38871 BDF1YLR399C 2061 nt13.02□□□□□ -0.33
SSP1P38871 SWP1YMR149W 861 nt13.02□□□□□ -0.33
SSP1P38871 EMI2YDR516C 1503 nt13.01□□□□□ -0.33
SSP1P38871 CCT6YDR188W 1641 nt13□□□□□ -0.33
SSP1P38871 PTP1YDL230W 1008 nt13□□□□□ -0.33
SSP1P38871 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.99□□□□□ -0.33
SSP1P38871 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.99□□□□□ -0.33
SSP1P38871 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.99□□□□□ -0.33
SSP1P38871 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.99□□□□□ -0.33
SSP1P38871 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.99□□□□□ -0.33
SSP1P38871 SED5YLR026C 1023 nt12.98□□□□□ -0.33
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