Protein–RNA interactions for Protein: P38799

YHR078W, Uncharacterized protein YHR078W, yeastyeast

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR078WP38799 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.26□□□□□ -0.45
YHR078WP38799 DSK2YMR276W 1122 nt12.26□□□□□ -0.45
YHR078WP38799 ALF1YNL148C 765 nt12.25□□□□□ -0.45
YHR078WP38799 TAT1YBR069C 1860 nt12.23□□□□□ -0.45
YHR078WP38799 MEP2YNL142W 1500 nt12.22□□□□□ -0.45
YHR078WP38799 FMP45YDL222C 930 nt12.2□□□□□ -0.46
YHR078WP38799 YPR011CYPR011C 981 nt12.17□□□□□ -0.46
YHR078WP38799 YLR236CYLR236C 324 nt12.14□□□□□ -0.47
YHR078WP38799 YPS1YLR120C 1710 nt12.14□□□□□ -0.47
YHR078WP38799 YDR095CYDR095C 411 nt12.13□□□□□ -0.47
YHR078WP38799 YCH1YGR203W 447 nt12.11□□□□□ -0.47
YHR078WP38799 YJL152WYJL152W 360 nt12.07□□□□□ -0.48
YHR078WP38799 SIS1YNL007C 1059 nt12.04□□□□□ -0.48
YHR078WP38799 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12□□□□□ -0.49
YHR078WP38799 IDH1YNL037C 1083 nt12□□□□□ -0.49
YHR078WP38799 MRPL8YJL063C 717 nt11.99□□□□□ -0.49
YHR078WP38799 DCW1YKL046C 1350 nt11.97□□□□□ -0.49
YHR078WP38799 ERV46YAL042W 1248 nt11.95□□□□□ -0.5
YHR078WP38799 LPX1YOR084W 1164 nt11.93□□□□□ -0.5
YHR078WP38799 PAC11YDR488C 1602 nt11.91□□□□□ -0.5
YHR078WP38799 RPP2AYOL039W 321 nt11.91□□□□□ -0.5
YHR078WP38799 TIR4YOR009W 1464 nt11.89□□□□□ -0.51
YHR078WP38799 YDR433WYDR433W 441 nt11.87□□□□□ -0.51
YHR078WP38799 YBR220CYBR220C 1683 nt11.86□□□□□ -0.51
YHR078WP38799 YKR040CYKR040C 504 nt11.84□□□□□ -0.51
YHR078WP38799 ADO1YJR105W 1023 nt11.83□□□□□ -0.52
YHR078WP38799 GBP2YCL011C 1284 nt11.83□□□□□ -0.52
YHR078WP38799 EMI2YDR516C 1503 nt11.81□□□□□ -0.52
YHR078WP38799 PET9YBL030C 957 nt11.8□□□□□ -0.52
YHR078WP38799 YMR090WYMR090W 684 nt11.8□□□□□ -0.52
YHR078WP38799 SPP1YPL138C 1062 nt11.8□□□□□ -0.52
YHR078WP38799 CAC2YML102W 1407 nt11.79□□□□□ -0.52
YHR078WP38799 ART5YGR068C 1761 nt11.78□□□□□ -0.52
YHR078WP38799 PTP1YDL230W 1008 nt11.78□□□□□ -0.52
YHR078WP38799 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.77□□□□□ -0.53
YHR078WP38799 YEL076CYEL076C 651 nt11.77□□□□□ -0.53
YHR078WP38799 YLR464WYLR464W 651 nt11.77□□□□□ -0.53
YHR078WP38799 YMR057CYMR057C 372 nt11.74□□□□□ -0.53
YHR078WP38799 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.74□□□□□ -0.53
YHR078WP38799 RTG1YOL067C 534 nt11.72□□□□□ -0.53
YHR078WP38799 GFD2YCL036W 1701 nt11.71□□□□□ -0.54
YHR078WP38799 MXR2YCL033C 507 nt11.7□□□□□ -0.54
YHR078WP38799 SDH1YKL148C 1923 nt11.69□□□□□ -0.54
YHR078WP38799 YDL221WYDL221W 552 nt11.69□□□□□ -0.54
YHR078WP38799 TCD2YKL027W 1344 nt11.67□□□□□ -0.54
YHR078WP38799 YJL225CYJL225C 5277 nt11.62□□□□□ -0.55
YHR078WP38799 PCH2YBR186W 1695 nt11.6□□□□□ -0.55
YHR078WP38799 NVJ2YPR091C 2313 nt11.6□□□□□ -0.55
YHR078WP38799 GUT2YIL155C 1950 nt11.57□□□□□ -0.56
YHR078WP38799 SEC11YIR022W 504 nt11.56□□□□□ -0.56
YHR078WP38799 HUA1YGR268C 597 nt11.55□□□□□ -0.56
YHR078WP38799 UBX6YJL048C 1191 nt11.54□□□□□ -0.56
YHR078WP38799 FPS1YLL043W 2010 nt11.53□□□□□ -0.56
YHR078WP38799 DED1YOR204W 1815 nt11.51□□□□□ -0.57
YHR078WP38799 RRD1YIL153W 1182 nt11.51□□□□□ -0.57
YHR078WP38799 FRD1YEL047C 1413 nt11.51□□□□□ -0.57
YHR078WP38799 RTS2YOR077W 699 nt11.5□□□□□ -0.57
YHR078WP38799 SCC4YER147C 1875 nt11.49□□□□□ -0.57
YHR078WP38799 CUE1YMR264W 612 nt11.45□□□□□ -0.58
YHR078WP38799 YCL042WYCL042W 360 nt11.45□□□□□ -0.58
YHR078WP38799 IRC15YPL017C 1500 nt11.45□□□□□ -0.58
YHR078WP38799 SOR2YDL246C 1074 nt11.41□□□□□ -0.58
YHR078WP38799 SOR1YJR159W 1074 nt11.41□□□□□ -0.58
YHR078WP38799 PIB2YGL023C 1908 nt11.41□□□□□ -0.58
YHR078WP38799 YLR235CYLR235C 399 nt11.4□□□□□ -0.58
YHR078WP38799 YDR094WYDR094W 336 nt11.39□□□□□ -0.59
YHR078WP38799 YKL030WYKL030W 606 nt11.38□□□□□ -0.59
YHR078WP38799 FMT1YBL013W 1206 nt11.38□□□□□ -0.59
YHR078WP38799 PTH1YHR189W 573 nt11.37□□□□□ -0.59
YHR078WP38799 FMP52YER004W 696 nt11.36□□□□□ -0.59
YHR078WP38799 GIS3YLR094C 1509 nt11.35□□□□□ -0.59
YHR078WP38799 YIL100WYIL100W 354 nt11.33□□□□□ -0.6
YHR078WP38799 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.3□□□□□ -0.6
YHR078WP38799 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.3□□□□□ -0.6
YHR078WP38799 YSC84YHR016C 1407 nt11.29□□□□□ -0.6
YHR078WP38799 LCB1YMR296C 1677 nt11.27□□□□□ -0.61
YHR078WP38799 CWP1YKL096W 720 nt11.26□□□□□ -0.61
YHR078WP38799 RTF1YGL244W 1677 nt11.24□□□□□ -0.61
YHR078WP38799 YHL050CYHL050C 2094 nt11.24□□□□□ -0.61
YHR078WP38799 ADH2YMR303C 1047 nt11.21□□□□□ -0.61
YHR078WP38799 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.18□□□□□ -0.62
YHR078WP38799 TIM23YNR017W 669 nt11.17□□□□□ -0.62
YHR078WP38799 SNF6YHL025W 999 nt11.14□□□□□ -0.63
YHR078WP38799 DIC1YLR348C 897 nt11.14□□□□□ -0.63
YHR078WP38799 PCM1YEL058W 1674 nt11.14□□□□□ -0.63
YHR078WP38799 BOP3YNL042W 1191 nt11.13□□□□□ -0.63
YHR078WP38799 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.12□□□□□ -0.63
YHR078WP38799 PTK1YKL198C 1989 nt11.1□□□□□ -0.63
YHR078WP38799 YLR179CYLR179C 606 nt11.08□□□□□ -0.64
YHR078WP38799 YNL195CYNL195C 786 nt11.08□□□□□ -0.64
YHR078WP38799 RNQ1YCL028W 1218 nt11.07□□□□□ -0.64
YHR078WP38799 RRT12YCR045C 1476 nt11.06□□□□□ -0.64
YHR078WP38799 YPR064WYPR064W 420 nt11.06□□□□□ -0.64
YHR078WP38799 YIH1YCR059C 777 nt11.05□□□□□ -0.64
YHR078WP38799 YFR018CYFR018C 1092 nt11.05□□□□□ -0.64
YHR078WP38799 RRT5YFR032C 870 nt11.01□□□□□ -0.65
YHR078WP38799 PAU16YKL224C 372 nt11□□□□□ -0.65
YHR078WP38799 TAD3YLR316C 969 nt11□□□□□ -0.65
YHR078WP38799 AHT1YHR093W 549 nt10.97□□□□□ -0.65
YHR078WP38799 WSC2YNL283C 1512 nt10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.3 ms