Protein–RNA interactions for Protein: P38796

PPE1, Protein phosphatase methylesterase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PPE1P38796 CAC2YML102W 1407 nt12.55□□□□□ -0.4
PPE1P38796 WHI5YOR083W 888 nt12.54□□□□□ -0.4
PPE1P38796 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.53□□□□□ -0.4
PPE1P38796 ART5YGR068C 1761 nt12.51□□□□□ -0.41
PPE1P38796 EMI2YDR516C 1503 nt12.5□□□□□ -0.41
PPE1P38796 TIR4YOR009W 1464 nt12.49□□□□□ -0.41
PPE1P38796 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.48□□□□□ -0.41
PPE1P38796 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.48□□□□□ -0.41
PPE1P38796 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.48□□□□□ -0.41
PPE1P38796 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.48□□□□□ -0.41
PPE1P38796 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.48□□□□□ -0.41
PPE1P38796 YJL152WYJL152W 360 nt12.45□□□□□ -0.42
PPE1P38796 GFD2YCL036W 1701 nt12.45□□□□□ -0.42
PPE1P38796 PUS2YGL063W 1113 nt12.43□□□□□ -0.42
PPE1P38796 YDL221WYDL221W 552 nt12.41□□□□□ -0.42
PPE1P38796 YCH1YGR203W 447 nt12.39□□□□□ -0.43
PPE1P38796 PET9YBL030C 957 nt12.39□□□□□ -0.43
PPE1P38796 YMR090WYMR090W 684 nt12.36□□□□□ -0.43
PPE1P38796 IRC15YPL017C 1500 nt12.36□□□□□ -0.43
PPE1P38796 YMR057CYMR057C 372 nt12.35□□□□□ -0.43
PPE1P38796 RTS2YOR077W 699 nt12.33□□□□□ -0.44
PPE1P38796 YBR220CYBR220C 1683 nt12.28□□□□□ -0.44
PPE1P38796 YPR011CYPR011C 981 nt12.27□□□□□ -0.45
PPE1P38796 GIS3YLR094C 1509 nt12.27□□□□□ -0.45
PPE1P38796 YLR236CYLR236C 324 nt12.26□□□□□ -0.45
PPE1P38796 DSK2YMR276W 1122 nt12.26□□□□□ -0.45
PPE1P38796 SDH1YKL148C 1923 nt12.25□□□□□ -0.45
PPE1P38796 IMP2'YIL154C 1041 nt12.2□□□□□ -0.46
PPE1P38796 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.19□□□□□ -0.46
PPE1P38796 FPS1YLL043W 2010 nt12.19□□□□□ -0.46
PPE1P38796 SCC4YER147C 1875 nt12.19□□□□□ -0.46
PPE1P38796 IDH1YNL037C 1083 nt12.18□□□□□ -0.46
PPE1P38796 CUE1YMR264W 612 nt12.17□□□□□ -0.46
PPE1P38796 BDF1YLR399C 2061 nt12.12□□□□□ -0.47
PPE1P38796 FMP45YDL222C 930 nt12.12□□□□□ -0.47
PPE1P38796 GBP2YCL011C 1284 nt12.12□□□□□ -0.47
PPE1P38796 LPX1YOR084W 1164 nt12.06□□□□□ -0.48
PPE1P38796 YDR433WYDR433W 441 nt12.05□□□□□ -0.48
PPE1P38796 YIL100WYIL100W 354 nt12.01□□□□□ -0.49
PPE1P38796 ERV46YAL042W 1248 nt12.01□□□□□ -0.49
PPE1P38796 MXR2YCL033C 507 nt12.01□□□□□ -0.49
PPE1P38796 RRD1YIL153W 1182 nt11.99□□□□□ -0.49
PPE1P38796 DED1YOR204W 1815 nt11.97□□□□□ -0.49
PPE1P38796 TAT1YBR069C 1860 nt11.96□□□□□ -0.49
PPE1P38796 TCD2YKL027W 1344 nt11.96□□□□□ -0.49
PPE1P38796 MRPL8YJL063C 717 nt11.93□□□□□ -0.5
PPE1P38796 YKR040CYKR040C 504 nt11.92□□□□□ -0.5
PPE1P38796 YSC84YHR016C 1407 nt11.9□□□□□ -0.5
PPE1P38796 RRT12YCR045C 1476 nt11.89□□□□□ -0.51
PPE1P38796 FMT1YBL013W 1206 nt11.86□□□□□ -0.51
PPE1P38796 YHL050CYHL050C 2094 nt11.86□□□□□ -0.51
PPE1P38796 YNL195CYNL195C 786 nt11.84□□□□□ -0.51
PPE1P38796 SPP1YPL138C 1062 nt11.83□□□□□ -0.52
PPE1P38796 FMP52YER004W 696 nt11.78□□□□□ -0.52
PPE1P38796 FRD1YEL047C 1413 nt11.77□□□□□ -0.52
PPE1P38796 SEC11YIR022W 504 nt11.77□□□□□ -0.53
PPE1P38796 PCH2YBR186W 1695 nt11.75□□□□□ -0.53
PPE1P38796 SOR2YDL246C 1074 nt11.73□□□□□ -0.53
PPE1P38796 SOR1YJR159W 1074 nt11.73□□□□□ -0.53
PPE1P38796 CWP1YKL096W 720 nt11.73□□□□□ -0.53
PPE1P38796 YCL042WYCL042W 360 nt11.73□□□□□ -0.53
PPE1P38796 ADH2YMR303C 1047 nt11.72□□□□□ -0.53
PPE1P38796 PCM1YEL058W 1674 nt11.69□□□□□ -0.54
PPE1P38796 ADO1YJR105W 1023 nt11.69□□□□□ -0.54
PPE1P38796 GUT2YIL155C 1950 nt11.68□□□□□ -0.54
PPE1P38796 UBX6YJL048C 1191 nt11.64□□□□□ -0.55
PPE1P38796 SNF6YHL025W 999 nt11.61□□□□□ -0.55
PPE1P38796 PTH1YHR189W 573 nt11.58□□□□□ -0.56
PPE1P38796 LCB1YMR296C 1677 nt11.56□□□□□ -0.56
PPE1P38796 PIB2YGL023C 1908 nt11.55□□□□□ -0.56
PPE1P38796 RTG1YOL067C 534 nt11.54□□□□□ -0.56
PPE1P38796 SIM1YIL123W 1431 nt11.52□□□□□ -0.56
PPE1P38796 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.52□□□□□ -0.57
PPE1P38796 YEL076CYEL076C 651 nt11.52□□□□□ -0.57
PPE1P38796 YLR464WYLR464W 651 nt11.52□□□□□ -0.57
PPE1P38796 NCP1YHR042W 2076 nt11.51□□□□□ -0.57
PPE1P38796 RTF1YGL244W 1677 nt11.5□□□□□ -0.57
PPE1P38796 BIO4YNR057C 714 nt11.5□□□□□ -0.57
PPE1P38796 YIH1YCR059C 777 nt11.49□□□□□ -0.57
PPE1P38796 DIC1YLR348C 897 nt11.48□□□□□ -0.57
PPE1P38796 YLR235CYLR235C 399 nt11.47□□□□□ -0.57
PPE1P38796 BOP3YNL042W 1191 nt11.47□□□□□ -0.57
PPE1P38796 RNQ1YCL028W 1218 nt11.47□□□□□ -0.57
PPE1P38796 YLL053CYLL053C 459 nt11.42□□□□□ -0.58
PPE1P38796 PAC11YDR488C 1602 nt11.42□□□□□ -0.58
PPE1P38796 YKL030WYKL030W 606 nt11.41□□□□□ -0.58
PPE1P38796 TIM23YNR017W 669 nt11.37□□□□□ -0.59
PPE1P38796 PTK1YKL198C 1989 nt11.36□□□□□ -0.59
PPE1P38796 YLR179CYLR179C 606 nt11.33□□□□□ -0.6
PPE1P38796 FTR1YER145C 1215 nt11.32□□□□□ -0.6
PPE1P38796 LYS4YDR234W 2082 nt11.31□□□□□ -0.6
PPE1P38796 GAL1YBR020W 1587 nt11.29□□□□□ -0.6
PPE1P38796 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.29□□□□□ -0.6
PPE1P38796 ATF2YGR177C 1608 nt11.28□□□□□ -0.6
PPE1P38796 YDR094WYDR094W 336 nt11.28□□□□□ -0.6
PPE1P38796 HUA1YGR268C 597 nt11.28□□□□□ -0.6
PPE1P38796 ERF2YLR246W 1080 nt11.28□□□□□ -0.6
PPE1P38796 TRM5YHR070W 1500 nt11.28□□□□□ -0.6
PPE1P38796 CRR1YLR213C 1269 nt11.26□□□□□ -0.61
PPE1P38796 WSC2YNL283C 1512 nt11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.5 ms