Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	YHR165W-A	YHR165W-A	312 nt		12.71	□□□□□ -0.37
ATG12	P38316	DCW1	YKL046C	1350 nt		12.68	□□□□□ -0.38
ATG12	P38316	YLR154C-G	YLR154C-G	150 nt		12.67	□□□□□ -0.38
ATG12	P38316	MOT3	YMR070W	1473 nt		12.65	□□□□□ -0.38
ATG12	P38316	DSK2	YMR276W	1122 nt		12.63	□□□□□ -0.39
ATG12	P38316	IMP2'	YIL154C	1041 nt		12.62	□□□□□ -0.39
ATG12	P38316	FMP45	YDL222C	930 nt		12.59	□□□□□ -0.39
ATG12	P38316	YJL152W	YJL152W	360 nt		12.54	□□□□□ -0.4
ATG12	P38316	YPR011C	YPR011C	981 nt		12.52	□□□□□ -0.41
ATG12	P38316	YLR236C	YLR236C	324 nt		12.5	□□□□□ -0.41
ATG12	P38316	PTP1	YDL230W	1008 nt		12.49	□□□□□ -0.41
ATG12	P38316	EMI2	YDR516C	1503 nt		12.47	□□□□□ -0.41
ATG12	P38316	YCH1	YGR203W	447 nt		12.47	□□□□□ -0.41
ATG12	P38316	RPP2A	YOL039W	321 nt		12.47	□□□□□ -0.41
ATG12	P38316	SIS1	YNL007C	1059 nt		12.45	□□□□□ -0.42
ATG12	P38316	CAC2	YML102W	1407 nt		12.45	□□□□□ -0.42
ATG12	P38316	IDH1	YNL037C	1083 nt		12.4	□□□□□ -0.42
ATG12	P38316	BDF1	YLR399C	2061 nt		12.38	□□□□□ -0.43
ATG12	P38316	YDL221W	YDL221W	552 nt		12.36	□□□□□ -0.43
ATG12	P38316	YMR090W	YMR090W	684 nt		12.35	□□□□□ -0.43
ATG12	P38316	YBR220C	YBR220C	1683 nt		12.32	□□□□□ -0.44
ATG12	P38316	LPX1	YOR084W	1164 nt		12.31	□□□□□ -0.44
ATG12	P38316	TIR4	YOR009W	1464 nt		12.31	□□□□□ -0.44
ATG12	P38316	YDR433W	YDR433W	441 nt		12.29	□□□□□ -0.44
ATG12	P38316	ERV46	YAL042W	1248 nt		12.29	□□□□□ -0.44
ATG12	P38316	ART5	YGR068C	1761 nt		12.27	□□□□□ -0.45
ATG12	P38316	MRPL8	YJL063C	717 nt		12.26	□□□□□ -0.45
ATG12	P38316	GBP2	YCL011C	1284 nt		12.25	□□□□□ -0.45
ATG12	P38316	IRC15	YPL017C	1500 nt		12.25	□□□□□ -0.45
ATG12	P38316	SDH1	YKL148C	1923 nt		12.25	□□□□□ -0.45
ATG12	P38316	GFD2	YCL036W	1701 nt		12.23	□□□□□ -0.45
ATG12	P38316	YKR040C	YKR040C	504 nt		12.21	□□□□□ -0.45
ATG12	P38316	PET9	YBL030C	957 nt		12.21	□□□□□ -0.45
ATG12	P38316	TAT1	YBR069C	1860 nt		12.2	□□□□□ -0.46
ATG12	P38316	YMR057C	YMR057C	372 nt		12.18	□□□□□ -0.46
ATG12	P38316	YCL048W-A	YCL048W-A	240 nt		12.18	□□□□□ -0.46
ATG12	P38316	GIS3	YLR094C	1509 nt		12.16	□□□□□ -0.46
ATG12	P38316	SPP1	YPL138C	1062 nt		12.16	□□□□□ -0.46
ATG12	P38316	SCC4	YER147C	1875 nt		12.14	□□□□□ -0.47
ATG12	P38316	ADO1	YJR105W	1023 nt		12.14	□□□□□ -0.47
ATG12	P38316	RTS2	YOR077W	699 nt		12.14	□□□□□ -0.47
ATG12	P38316	MXR2	YCL033C	507 nt		12.11	□□□□□ -0.47
ATG12	P38316	YEL076C-A	YEL076C-A	651 nt		12.08	□□□□□ -0.48
ATG12	P38316	YEL076C	YEL076C	651 nt		12.08	□□□□□ -0.48
ATG12	P38316	YLR464W	YLR464W	651 nt		12.08	□□□□□ -0.48
ATG12	P38316	TCD2	YKL027W	1344 nt		12.08	□□□□□ -0.48
ATG12	P38316	RTG1	YOL067C	534 nt		12.01	□□□□□ -0.49
ATG12	P38316	CUE1	YMR264W	612 nt		11.99	□□□□□ -0.49
ATG12	P38316	FPS1	YLL043W	2010 nt		11.93	□□□□□ -0.5
ATG12	P38316	YSC84	YHR016C	1407 nt		11.9	□□□□□ -0.5
ATG12	P38316	HUA1	YGR268C	597 nt		11.89	□□□□□ -0.51
ATG12	P38316	RRD1	YIL153W	1182 nt		11.89	□□□□□ -0.51
ATG12	P38316	DED1	YOR204W	1815 nt		11.88	□□□□□ -0.51
ATG12	P38316	PCH2	YBR186W	1695 nt		11.87	□□□□□ -0.51
ATG12	P38316	SEC11	YIR022W	504 nt		11.87	□□□□□ -0.51
ATG12	P38316	FRD1	YEL047C	1413 nt		11.86	□□□□□ -0.51
ATG12	P38316	YCL042W	YCL042W	360 nt		11.86	□□□□□ -0.51
ATG12	P38316	RRT12	YCR045C	1476 nt		11.84	□□□□□ -0.51
ATG12	P38316	YHL050C	YHL050C	2094 nt		11.84	□□□□□ -0.51
ATG12	P38316	YIL100W	YIL100W	354 nt		11.83	□□□□□ -0.52
ATG12	P38316	UBX6	YJL048C	1191 nt		11.83	□□□□□ -0.52
ATG12	P38316	GUT2	YIL155C	1950 nt		11.81	□□□□□ -0.52
ATG12	P38316	PTH1	YHR189W	573 nt		11.77	□□□□□ -0.53
ATG12	P38316	YLR235C	YLR235C	399 nt		11.76	□□□□□ -0.53
ATG12	P38316	FMT1	YBL013W	1206 nt		11.76	□□□□□ -0.53
ATG12	P38316	SOR2	YDL246C	1074 nt		11.75	□□□□□ -0.53
ATG12	P38316	SOR1	YJR159W	1074 nt		11.75	□□□□□ -0.53
ATG12	P38316	YKL030W	YKL030W	606 nt		11.74	□□□□□ -0.53
ATG12	P38316	YNL195C	YNL195C	786 nt		11.74	□□□□□ -0.53
ATG12	P38316	FMP52	YER004W	696 nt		11.73	□□□□□ -0.53
ATG12	P38316	YDR094W	YDR094W	336 nt		11.68	□□□□□ -0.54
ATG12	P38316	CWP1	YKL096W	720 nt		11.68	□□□□□ -0.54
ATG12	P38316	PIB2	YGL023C	1908 nt		11.66	□□□□□ -0.54
ATG12	P38316	LCB1	YMR296C	1677 nt		11.63	□□□□□ -0.55
ATG12	P38316	ADH2	YMR303C	1047 nt		11.61	□□□□□ -0.55
ATG12	P38316	RTF1	YGL244W	1677 nt		11.59	□□□□□ -0.55
ATG12	P38316	SNF6	YHL025W	999 nt		11.54	□□□□□ -0.56
ATG12	P38316	PCM1	YEL058W	1674 nt		11.53	□□□□□ -0.56
ATG12	P38316	TIM23	YNR017W	669 nt		11.53	□□□□□ -0.56
ATG12	P38316	BOP3	YNL042W	1191 nt		11.52	□□□□□ -0.57
ATG12	P38316	DIC1	YLR348C	897 nt		11.51	□□□□□ -0.57
ATG12	P38316	NCP1	YHR042W	2076 nt		11.48	□□□□□ -0.57
ATG12	P38316	tL(GAG)G	tL(GAG)G	82 nt		11.46	□□□□□ -0.57
ATG12	P38316	YLR179C	YLR179C	606 nt		11.46	□□□□□ -0.57
ATG12	P38316	RNQ1	YCL028W	1218 nt		11.44	□□□□□ -0.58
ATG12	P38316	PTK1	YKL198C	1989 nt		11.44	□□□□□ -0.58
ATG12	P38316	YPR064W	YPR064W	420 nt		11.43	□□□□□ -0.58
ATG12	P38316	YFL015W-A	YFL015W-A	318 nt		11.42	□□□□□ -0.58
ATG12	P38316	YIH1	YCR059C	777 nt		11.4	□□□□□ -0.58
ATG12	P38316	PAC11	YDR488C	1602 nt		11.38	□□□□□ -0.59
ATG12	P38316	YFR018C	YFR018C	1092 nt		11.35	□□□□□ -0.59
ATG12	P38316	RRT5	YFR032C	870 nt		11.34	□□□□□ -0.59
ATG12	P38316	TAD3	YLR316C	969 nt		11.34	□□□□□ -0.59
ATG12	P38316	SIM1	YIL123W	1431 nt		11.34	□□□□□ -0.59
ATG12	P38316	PAU16	YKL224C	372 nt		11.31	□□□□□ -0.6
ATG12	P38316	AHT1	YHR093W	549 nt		11.3	□□□□□ -0.6
ATG12	P38316	YLL053C	YLL053C	459 nt		11.29	□□□□□ -0.6
ATG12	P38316	WSC2	YNL283C	1512 nt		11.28	□□□□□ -0.6
ATG12	P38316	BIO4	YNR057C	714 nt		11.27	□□□□□ -0.61
ATG12	P38316	AQY1	YPR192W	918 nt		11.27	□□□□□ -0.61

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