Protein–RNA interactions for Protein: P35209

SPT21, Protein SPT21, yeastyeast

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT21P35209 YPL071CYPL071C 471 nt15.32■□□□□ 0.04
SPT21P35209 KTR3YBR205W 1215 nt15.27■□□□□ 0.04
SPT21P35209 NPL3YDR432W 1245 nt15.25■□□□□ 0.03
SPT21P35209 ARE1YCR048W 1833 nt15.19■□□□□ 0.02
SPT21P35209 URE2YNL229C 1065 nt15.18■□□□□ 0.02
SPT21P35209 YJR018WYJR018W 363 nt15.17■□□□□ 0.02
SPT21P35209 HOM6YJR139C 1080 nt15.17■□□□□ 0.02
SPT21P35209 YJR120WYJR120W 351 nt15.16■□□□□ 0.02
SPT21P35209 NEM1YHR004C 1341 nt15.14■□□□□ 0.01
SPT21P35209 YGR021WYGR021W 873 nt15.13■□□□□ 0.01
SPT21P35209 WWM1YFL010C 636 nt15.12■□□□□ 0.01
SPT21P35209 SPT5YML010W 3192 nt15.12■□□□□ 0.01
SPT21P35209 MNP1YGL068W 585 nt15.11■□□□□ 0.01
SPT21P35209 PUN1YLR414C 792 nt15.1■□□□□ 0.01
SPT21P35209 SSA4YER103W 1929 nt15.07■□□□□ 0
SPT21P35209 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt15.04■□□□□ -0
SPT21P35209 YOL037CYOL037C 354 nt15.02■□□□□ -0
SPT21P35209 YHM2YMR241W 945 nt15□□□□□ -0.01
SPT21P35209 AST1YBL069W 1290 nt14.99□□□□□ -0.01
SPT21P35209 YHL044WYHL044W 708 nt14.98□□□□□ -0.01
SPT21P35209 PHO92YDR374C 921 nt14.97□□□□□ -0.01
SPT21P35209 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SPT21P35209 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SPT21P35209 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SPT21P35209 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SPT21P35209 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SPT21P35209 STD1YOR047C 1335 nt14.96□□□□□ -0.01
SPT21P35209 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt14.95□□□□□ -0.02
SPT21P35209 YJL107CYJL107C 1164 nt14.92□□□□□ -0.02
SPT21P35209 RKM5YLR137W 1104 nt14.92□□□□□ -0.02
SPT21P35209 PEX27YOR193W 1131 nt14.92□□□□□ -0.02
SPT21P35209 RPP2BYDR382W 333 nt14.9□□□□□ -0.02
SPT21P35209 FTR1YER145C 1215 nt14.9□□□□□ -0.02
SPT21P35209 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.9□□□□□ -0.02
SPT21P35209 YJL118WYJL118W 660 nt14.89□□□□□ -0.03
SPT21P35209 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.87□□□□□ -0.03
SPT21P35209 YMR057CYMR057C 372 nt14.87□□□□□ -0.03
SPT21P35209 PTC2YER089C 1395 nt14.85□□□□□ -0.03
SPT21P35209 RSM23YGL129C 1353 nt14.84□□□□□ -0.03
SPT21P35209 POA1YBR022W 534 nt14.82□□□□□ -0.04
SPT21P35209 LSM12YHR121W 564 nt14.81□□□□□ -0.04
SPT21P35209 THP3YPR045C 1413 nt14.78□□□□□ -0.04
SPT21P35209 YEL074WYEL074W 339 nt14.77□□□□□ -0.05
SPT21P35209 BDH2YAL061W 1254 nt14.77□□□□□ -0.05
SPT21P35209 BDF1YLR399C 2061 nt14.76□□□□□ -0.05
SPT21P35209 PAC11YDR488C 1602 nt14.75□□□□□ -0.05
SPT21P35209 YLR281CYLR281C 468 nt14.71□□□□□ -0.05
SPT21P35209 YLR036CYLR036C 612 nt14.69□□□□□ -0.06
SPT21P35209 MPS2YGL075C 1164 nt14.68□□□□□ -0.06
SPT21P35209 LSM3YLR438C-A 270 nt14.68□□□□□ -0.06
SPT21P35209 NVJ2YPR091C 2313 nt14.66□□□□□ -0.06
SPT21P35209 GTT3YEL017W 1014 nt14.66□□□□□ -0.06
SPT21P35209 FAR3YMR052W 615 nt14.66□□□□□ -0.06
SPT21P35209 PUS2YGL063W 1113 nt14.62□□□□□ -0.07
SPT21P35209 NAB2YGL122C 1578 nt14.6□□□□□ -0.07
SPT21P35209 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt14.59□□□□□ -0.07
SPT21P35209 INM2YDR287W 879 nt14.58□□□□□ -0.08
SPT21P35209 UBC12YLR306W 567 nt14.58□□□□□ -0.08
SPT21P35209 YML079WYML079W 606 nt14.56□□□□□ -0.08
SPT21P35209 WHI5YOR083W 888 nt14.55□□□□□ -0.08
SPT21P35209 MOD5YOR274W 1287 nt14.55□□□□□ -0.08
SPT21P35209 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt14.53□□□□□ -0.08
SPT21P35209 BUD23YCR047C 828 nt14.52□□□□□ -0.09
SPT21P35209 ARC19YKL013C 516 nt14.52□□□□□ -0.09
SPT21P35209 MPC1YGL080W 393 nt14.51□□□□□ -0.09
SPT21P35209 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt14.51□□□□□ -0.09
SPT21P35209 FIS1YIL065C 468 nt14.5□□□□□ -0.09
SPT21P35209 TAT1YBR069C 1860 nt14.5□□□□□ -0.09
SPT21P35209 BSC6YOL137W 1494 nt14.5□□□□□ -0.09
SPT21P35209 DAL1YIR027C 1383 nt14.49□□□□□ -0.09
SPT21P35209 YBL100CYBL100C 315 nt14.49□□□□□ -0.09
SPT21P35209 YHP1YDR451C 1062 nt14.48□□□□□ -0.09
SPT21P35209 COX3Q0275 810 nt14.48□□□□□ -0.09
SPT21P35209 YGL118CYGL118C 438 nt14.47□□□□□ -0.09
SPT21P35209 YPR011CYPR011C 981 nt14.39□□□□□ -0.11
SPT21P35209 PIC2YER053C 903 nt14.37□□□□□ -0.11
SPT21P35209 TRM9YML014W 840 nt14.37□□□□□ -0.11
SPT21P35209 RPM1RPM1 483 nt14.37□□□□□ -0.11
SPT21P35209 YNL040WYNL040W 1371 nt14.36□□□□□ -0.11
SPT21P35209 FUN26YAL022C 1554 nt14.36□□□□□ -0.11
SPT21P35209 PHO4YFR034C 939 nt14.36□□□□□ -0.11
SPT21P35209 FPR4YLR449W 1179 nt14.36□□□□□ -0.11
SPT21P35209 YBL081WYBL081W 1107 nt14.35□□□□□ -0.11
SPT21P35209 RUF21RUF21 707 nt14.34□□□□□ -0.11
SPT21P35209 STB1YNL309W 1263 nt14.34□□□□□ -0.11
SPT21P35209 YPR1YDR368W 939 nt14.33□□□□□ -0.12
SPT21P35209 SED5YLR026C 1023 nt14.31□□□□□ -0.12
SPT21P35209 ARP6YLR085C 1317 nt14.31□□□□□ -0.12
SPT21P35209 TSR2YLR435W 618 nt14.3□□□□□ -0.12
SPT21P35209 VPS28YPL065W 729 nt14.3□□□□□ -0.12
SPT21P35209 CCT6YDR188W 1641 nt14.28□□□□□ -0.12
SPT21P35209 YHR054CYHR054C 1065 nt14.28□□□□□ -0.12
SPT21P35209 YNL234WYNL234W 1281 nt14.28□□□□□ -0.12
SPT21P35209 YLR236CYLR236C 324 nt14.27□□□□□ -0.13
SPT21P35209 DSK2YMR276W 1122 nt14.27□□□□□ -0.13
SPT21P35209 PUS9YDL036C 1389 nt14.25□□□□□ -0.13
SPT21P35209 FPS1YLL043W 2010 nt14.25□□□□□ -0.13
SPT21P35209 YDL157CYDL157C 357 nt14.24□□□□□ -0.13
SPT21P35209 NEJ1YLR265C 1029 nt14.24□□□□□ -0.13
SPT21P35209 BNA3YJL060W 1335 nt14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.3 ms