Protein–RNA interactions for Protein: P34078

LTV1, Protein LTV1, yeastyeast

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LTV1P34078 RTF1YGL244W 1677 nt13.19□□□□□ -0.3
LTV1P34078 CCT6YDR188W 1641 nt13.17□□□□□ -0.3
LTV1P34078 GFD2YCL036W 1701 nt13.15□□□□□ -0.3
LTV1P34078 ART5YGR068C 1761 nt13.12□□□□□ -0.31
LTV1P34078 RTS2YOR077W 699 nt13.12□□□□□ -0.31
LTV1P34078 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.09□□□□□ -0.31
LTV1P34078 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.09□□□□□ -0.31
LTV1P34078 RRT12YCR045C 1476 nt13.09□□□□□ -0.31
LTV1P34078 BOP3YNL042W 1191 nt13.04□□□□□ -0.32
LTV1P34078 PTK1YKL198C 1989 nt13.02□□□□□ -0.32
LTV1P34078 LSM3YLR438C-A 270 nt13.02□□□□□ -0.33
LTV1P34078 WWM1YFL010C 636 nt12.98□□□□□ -0.33
LTV1P34078 PET9YBL030C 957 nt12.96□□□□□ -0.33
LTV1P34078 CUE1YMR264W 612 nt12.96□□□□□ -0.33
LTV1P34078 YNL195CYNL195C 786 nt12.92□□□□□ -0.34
LTV1P34078 UME6YDR207C 2511 nt12.89□□□□□ -0.35
LTV1P34078 YCH1YGR203W 447 nt12.81□□□□□ -0.36
LTV1P34078 YIL100WYIL100W 354 nt12.8□□□□□ -0.36
LTV1P34078 NCP1YHR042W 2076 nt12.8□□□□□ -0.36
LTV1P34078 TIR4YOR009W 1464 nt12.78□□□□□ -0.36
LTV1P34078 BOR1YNL275W 1731 nt12.76□□□□□ -0.37
LTV1P34078 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.75□□□□□ -0.37
LTV1P34078 YMR057CYMR057C 372 nt12.74□□□□□ -0.37
LTV1P34078 YFL054CYFL054C 1941 nt12.72□□□□□ -0.37
LTV1P34078 SPT8YLR055C 1809 nt12.66□□□□□ -0.38
LTV1P34078 YLR236CYLR236C 324 nt12.64□□□□□ -0.39
LTV1P34078 YGR021WYGR021W 873 nt12.6□□□□□ -0.39
LTV1P34078 PST2YDR032C 597 nt12.59□□□□□ -0.39
LTV1P34078 HOM6YJR139C 1080 nt12.55□□□□□ -0.4
LTV1P34078 LCB1YMR296C 1677 nt12.51□□□□□ -0.41
LTV1P34078 HSP60YLR259C 1719 nt12.41□□□□□ -0.42
LTV1P34078 SWE1YJL187C 2460 nt12.39□□□□□ -0.43
LTV1P34078 MNP1YGL068W 585 nt12.38□□□□□ -0.43
LTV1P34078 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.38□□□□□ -0.43
LTV1P34078 NPL3YDR432W 1245 nt12.37□□□□□ -0.43
LTV1P34078 RKM5YLR137W 1104 nt12.36□□□□□ -0.43
LTV1P34078 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.36□□□□□ -0.43
LTV1P34078 MCH5YOR306C 1566 nt12.33□□□□□ -0.44
LTV1P34078 Q0182Q0182 405 nt12.32□□□□□ -0.44
LTV1P34078 YJL152WYJL152W 360 nt12.32□□□□□ -0.44
LTV1P34078 ALG12YNR030W 1656 nt12.3□□□□□ -0.44
LTV1P34078 YJL225CYJL225C 5277 nt12.29□□□□□ -0.44
LTV1P34078 SHU1YHL006C 453 nt12.29□□□□□ -0.44
LTV1P34078 LYS4YDR234W 2082 nt12.26□□□□□ -0.45
LTV1P34078 GLK1YCL040W 1503 nt12.22□□□□□ -0.45
LTV1P34078 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.22□□□□□ -0.45
LTV1P34078 SIM1YIL123W 1431 nt12.18□□□□□ -0.46
LTV1P34078 FUR4YBR021W 1902 nt12.08□□□□□ -0.48
LTV1P34078 PCM1YEL058W 1674 nt12.08□□□□□ -0.48
LTV1P34078 RRD1YIL153W 1182 nt12.08□□□□□ -0.48
LTV1P34078 FMP52YER004W 696 nt12.04□□□□□ -0.48
LTV1P34078 BIO4YNR057C 714 nt12.04□□□□□ -0.48
LTV1P34078 DSK2YMR276W 1122 nt11.96□□□□□ -0.49
LTV1P34078 NAR1YNL240C 1476 nt11.95□□□□□ -0.5
LTV1P34078 PRP4YPR178W 1398 nt11.95□□□□□ -0.5
LTV1P34078 DED1YOR204W 1815 nt11.94□□□□□ -0.5
LTV1P34078 AAC1YMR056C 930 nt11.93□□□□□ -0.5
LTV1P34078 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.92□□□□□ -0.5
LTV1P34078 YEL076CYEL076C 651 nt11.92□□□□□ -0.5
LTV1P34078 YLR464WYLR464W 651 nt11.92□□□□□ -0.5
LTV1P34078 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.9□□□□□ -0.5
LTV1P34078 FMT1YBL013W 1206 nt11.9□□□□□ -0.5
LTV1P34078 DPS1YLL018C 1674 nt11.9□□□□□ -0.5
LTV1P34078 SNF6YHL025W 999 nt11.89□□□□□ -0.51
LTV1P34078 ADH2YMR303C 1047 nt11.89□□□□□ -0.51
LTV1P34078 CCA1YER168C 1641 nt11.89□□□□□ -0.51
LTV1P34078 ERF2YLR246W 1080 nt11.88□□□□□ -0.51
LTV1P34078 CRR1YLR213C 1269 nt11.87□□□□□ -0.51
LTV1P34078 GBP2YCL011C 1284 nt11.86□□□□□ -0.51
LTV1P34078 CWP1YKL096W 720 nt11.85□□□□□ -0.51
LTV1P34078 TCD2YKL027W 1344 nt11.84□□□□□ -0.51
LTV1P34078 IDH1YNL037C 1083 nt11.82□□□□□ -0.52
LTV1P34078 YOL037CYOL037C 354 nt11.81□□□□□ -0.52
LTV1P34078 BIO5YNR056C 1686 nt11.81□□□□□ -0.52
LTV1P34078 MIC10YCL057C-A 294 nt11.79□□□□□ -0.52
LTV1P34078 RAX1YOR301W 1308 nt11.79□□□□□ -0.52
LTV1P34078 SNF1YDR477W 1902 nt11.76□□□□□ -0.53
LTV1P34078 HEM12YDR047W 1089 nt11.76□□□□□ -0.53
LTV1P34078 BMT6YLR063W 1098 nt11.76□□□□□ -0.53
LTV1P34078 PBP1YGR178C 2169 nt11.74□□□□□ -0.53
LTV1P34078 YKR005CYKR005C 1578 nt11.74□□□□□ -0.53
LTV1P34078 WHI5YOR083W 888 nt11.72□□□□□ -0.53
LTV1P34078 ATF2YGR177C 1608 nt11.71□□□□□ -0.54
LTV1P34078 YIH1YCR059C 777 nt11.7□□□□□ -0.54
LTV1P34078 YLL053CYLL053C 459 nt11.7□□□□□ -0.54
LTV1P34078 SNG1YGR197C 1644 nt11.7□□□□□ -0.54
LTV1P34078 CYT2YKL087C 675 nt11.68□□□□□ -0.54
LTV1P34078 YKL097CYKL097C 411 nt11.64□□□□□ -0.55
LTV1P34078 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.63□□□□□ -0.55
LTV1P34078 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.63□□□□□ -0.55
LTV1P34078 SOR2YDL246C 1074 nt11.63□□□□□ -0.55
LTV1P34078 SOR1YJR159W 1074 nt11.63□□□□□ -0.55
LTV1P34078 WSC2YNL283C 1512 nt11.63□□□□□ -0.55
LTV1P34078 YFL067WYFL067W 528 nt11.61□□□□□ -0.55
LTV1P34078 YLR281CYLR281C 468 nt11.61□□□□□ -0.55
LTV1P34078 RNQ1YCL028W 1218 nt11.61□□□□□ -0.55
LTV1P34078 YGR259CYGR259C 441 nt11.58□□□□□ -0.56
LTV1P34078 MOT3YMR070W 1473 nt11.57□□□□□ -0.56
LTV1P34078 YCL042WYCL042W 360 nt11.57□□□□□ -0.56
LTV1P34078 CMP2YML057W 1815 nt11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.8 ms