Protein–RNA interactions for Protein: P32610

VMA8, V-type proton ATPase subunit D, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VMA8P32610 SCC4YER147C 1875 nt10.79□□□□□ -0.68
VMA8P32610 TRM9YML014W 840 nt10.79□□□□□ -0.68
VMA8P32610 SRB2YHR041C 633 nt10.77□□□□□ -0.69
VMA8P32610 FRE6YLL051C 2139 nt10.76□□□□□ -0.69
VMA8P32610 LSM3YLR438C-A 270 nt10.74□□□□□ -0.69
VMA8P32610 RPP2AYOL039W 321 nt10.7□□□□□ -0.7
VMA8P32610 WWM1YFL010C 636 nt10.68□□□□□ -0.7
VMA8P32610 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.68□□□□□ -0.7
VMA8P32610 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.68□□□□□ -0.7
VMA8P32610 BOP3YNL042W 1191 nt10.68□□□□□ -0.7
VMA8P32610 YSC84YHR016C 1407 nt10.67□□□□□ -0.7
VMA8P32610 CAC2YML102W 1407 nt10.66□□□□□ -0.7
VMA8P32610 CCT6YDR188W 1641 nt10.66□□□□□ -0.7
VMA8P32610 PTK1YKL198C 1989 nt10.64□□□□□ -0.71
VMA8P32610 YGR021WYGR021W 873 nt10.63□□□□□ -0.71
VMA8P32610 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.6□□□□□ -0.71
VMA8P32610 ALG12YNR030W 1656 nt10.6□□□□□ -0.71
VMA8P32610 PTP1YDL230W 1008 nt10.59□□□□□ -0.71
VMA8P32610 SIS1YNL007C 1059 nt10.58□□□□□ -0.72
VMA8P32610 YHL050CYHL050C 2094 nt10.56□□□□□ -0.72
VMA8P32610 IRC15YPL017C 1500 nt10.53□□□□□ -0.72
VMA8P32610 GIS3YLR094C 1509 nt10.48□□□□□ -0.73
VMA8P32610 SHU1YHL006C 453 nt10.48□□□□□ -0.73
VMA8P32610 HOM6YJR139C 1080 nt10.48□□□□□ -0.73
VMA8P32610 HSP60YLR259C 1719 nt10.44□□□□□ -0.74
VMA8P32610 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.4□□□□□ -0.74
VMA8P32610 SPT8YLR055C 1809 nt10.4□□□□□ -0.75
VMA8P32610 YFL054CYFL054C 1941 nt10.39□□□□□ -0.75
VMA8P32610 YCH1YGR203W 447 nt10.39□□□□□ -0.75
VMA8P32610 PET9YBL030C 957 nt10.39□□□□□ -0.75
VMA8P32610 ART5YGR068C 1761 nt10.39□□□□□ -0.75
VMA8P32610 GFD2YCL036W 1701 nt10.37□□□□□ -0.75
VMA8P32610 RKM5YLR137W 1104 nt10.34□□□□□ -0.75
VMA8P32610 RRT12YCR045C 1476 nt10.33□□□□□ -0.76
VMA8P32610 MNP1YGL068W 585 nt10.31□□□□□ -0.76
VMA8P32610 YKL097CYKL097C 411 nt10.31□□□□□ -0.76
VMA8P32610 YNL195CYNL195C 786 nt10.29□□□□□ -0.76
VMA8P32610 NAR1YNL240C 1476 nt10.26□□□□□ -0.77
VMA8P32610 RTS2YOR077W 699 nt10.26□□□□□ -0.77
VMA8P32610 CUE1YMR264W 612 nt10.25□□□□□ -0.77
VMA8P32610 TIR4YOR009W 1464 nt10.22□□□□□ -0.77
VMA8P32610 GLK1YCL040W 1503 nt10.21□□□□□ -0.78
VMA8P32610 NCP1YHR042W 2076 nt10.21□□□□□ -0.78
VMA8P32610 YIL100WYIL100W 354 nt10.19□□□□□ -0.78
VMA8P32610 DSK2YMR276W 1122 nt10.19□□□□□ -0.78
VMA8P32610 YMR057CYMR057C 372 nt10.17□□□□□ -0.78
VMA8P32610 SSN3YPL042C 1668 nt10.16□□□□□ -0.78
VMA8P32610 YLR236CYLR236C 324 nt10.14□□□□□ -0.79
VMA8P32610 YOL037CYOL037C 354 nt10.14□□□□□ -0.79
VMA8P32610 BSP1YPR171W 1731 nt10.13□□□□□ -0.79
VMA8P32610 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.12□□□□□ -0.79
VMA8P32610 NPL3YDR432W 1245 nt10.11□□□□□ -0.79
VMA8P32610 YJL152WYJL152W 360 nt10.11□□□□□ -0.79
VMA8P32610 SWE1YJL187C 2460 nt10.1□□□□□ -0.79
VMA8P32610 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.08□□□□□ -0.8
VMA8P32610 CMP2YML057W 1815 nt10.07□□□□□ -0.8
VMA8P32610 AAC1YMR056C 930 nt10.03□□□□□ -0.8
VMA8P32610 HSL7YBR133C 2484 nt9.99□□□□□ -0.81
VMA8P32610 CYT2YKL087C 675 nt9.95□□□□□ -0.82
VMA8P32610 PBP1YGR178C 2169 nt9.91□□□□□ -0.82
VMA8P32610 PRP4YPR178W 1398 nt9.9□□□□□ -0.82
VMA8P32610 FUR4YBR021W 1902 nt9.9□□□□□ -0.82
VMA8P32610 WHI5YOR083W 888 nt9.9□□□□□ -0.82
VMA8P32610 DED1YOR204W 1815 nt9.88□□□□□ -0.83
VMA8P32610 YLR281CYLR281C 468 nt9.87□□□□□ -0.83
VMA8P32610 IDH1YNL037C 1083 nt9.87□□□□□ -0.83
VMA8P32610 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.86□□□□□ -0.83
VMA8P32610 YEL076CYEL076C 651 nt9.86□□□□□ -0.83
VMA8P32610 YLR464WYLR464W 651 nt9.86□□□□□ -0.83
VMA8P32610 YOR139CYOR139C 393 nt9.86□□□□□ -0.83
VMA8P32610 HEL2YDR266C 1920 nt9.86□□□□□ -0.83
VMA8P32610 DPS1YLL018C 1674 nt9.85□□□□□ -0.83
VMA8P32610 BIO5YNR056C 1686 nt9.85□□□□□ -0.83
VMA8P32610 UBX6YJL048C 1191 nt9.84□□□□□ -0.83
VMA8P32610 LCB1YMR296C 1677 nt9.83□□□□□ -0.84
VMA8P32610 FMP52YER004W 696 nt9.81□□□□□ -0.84
VMA8P32610 IMP2'YIL154C 1041 nt9.81□□□□□ -0.84
VMA8P32610 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.81□□□□□ -0.84
VMA8P32610 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.81□□□□□ -0.84
VMA8P32610 GBP2YCL011C 1284 nt9.8□□□□□ -0.84
VMA8P32610 BMT6YLR063W 1098 nt9.79□□□□□ -0.84
VMA8P32610 BIO4YNR057C 714 nt9.79□□□□□ -0.84
VMA8P32610 TCD2YKL027W 1344 nt9.77□□□□□ -0.85
VMA8P32610 RRD1YIL153W 1182 nt9.74□□□□□ -0.85
VMA8P32610 NDI1YML120C 1542 nt9.72□□□□□ -0.85
VMA8P32610 SNF1YDR477W 1902 nt9.68□□□□□ -0.86
VMA8P32610 PCM1YEL058W 1674 nt9.67□□□□□ -0.86
VMA8P32610 SIM1YIL123W 1431 nt9.66□□□□□ -0.86
VMA8P32610 PUS2YGL063W 1113 nt9.66□□□□□ -0.86
VMA8P32610 GID7YCL039W 2238 nt9.66□□□□□ -0.86
VMA8P32610 MET2YNL277W 1461 nt9.65□□□□□ -0.87
VMA8P32610 SNF6YHL025W 999 nt9.62□□□□□ -0.87
VMA8P32610 YDR433WYDR433W 441 nt9.61□□□□□ -0.87
VMA8P32610 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.6□□□□□ -0.87
VMA8P32610 YAT1YAR035W 2064 nt9.6□□□□□ -0.87
VMA8P32610 LYS4YDR234W 2082 nt9.59□□□□□ -0.87
VMA8P32610 YKR005CYKR005C 1578 nt9.58□□□□□ -0.88
VMA8P32610 CWP1YKL096W 720 nt9.58□□□□□ -0.88
VMA8P32610 FMT1YBL013W 1206 nt9.57□□□□□ -0.88
VMA8P32610 YCL042WYCL042W 360 nt9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms