Protein–RNA interactions for Protein: P32380

SPC110, Spindle pole body component 110, yeastyeast

Predictions only

Length 944 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC110P32380 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.59□□□□□ -0.23
SPC110P32380 SCC4YER147C 1875 nt13.53□□□□□ -0.24
SPC110P32380 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.5□□□□□ -0.25
SPC110P32380 IRC15YPL017C 1500 nt13.49□□□□□ -0.25
SPC110P32380 HOM6YJR139C 1080 nt13.47□□□□□ -0.25
SPC110P32380 ART5YGR068C 1761 nt13.45□□□□□ -0.26
SPC110P32380 GIS3YLR094C 1509 nt13.44□□□□□ -0.26
SPC110P32380 GFD2YCL036W 1701 nt13.43□□□□□ -0.26
SPC110P32380 SEC11YIR022W 504 nt13.4□□□□□ -0.26
SPC110P32380 PET9YBL030C 957 nt13.38□□□□□ -0.27
SPC110P32380 RTS2YOR077W 699 nt13.38□□□□□ -0.27
SPC110P32380 PCH2YBR186W 1695 nt13.35□□□□□ -0.27
SPC110P32380 MNP1YGL068W 585 nt13.33□□□□□ -0.28
SPC110P32380 UME6YDR207C 2511 nt13.32□□□□□ -0.28
SPC110P32380 YCH1YGR203W 447 nt13.31□□□□□ -0.28
SPC110P32380 RKM5YLR137W 1104 nt13.29□□□□□ -0.28
SPC110P32380 GUT2YIL155C 1950 nt13.27□□□□□ -0.29
SPC110P32380 YSC84YHR016C 1407 nt13.25□□□□□ -0.29
SPC110P32380 CUE1YMR264W 612 nt13.24□□□□□ -0.29
SPC110P32380 TIR4YOR009W 1464 nt13.23□□□□□ -0.29
SPC110P32380 YMR057CYMR057C 372 nt13.19□□□□□ -0.3
SPC110P32380 YNL195CYNL195C 786 nt13.17□□□□□ -0.3
SPC110P32380 YIL100WYIL100W 354 nt13.16□□□□□ -0.3
SPC110P32380 YOR139CYOR139C 393 nt13.14□□□□□ -0.31
SPC110P32380 YHL050CYHL050C 2094 nt13.11□□□□□ -0.31
SPC110P32380 RRT12YCR045C 1476 nt13.1□□□□□ -0.31
SPC110P32380 YJL152WYJL152W 360 nt13.08□□□□□ -0.32
SPC110P32380 NPL3YDR432W 1245 nt13.07□□□□□ -0.32
SPC110P32380 YLR236CYLR236C 324 nt13.06□□□□□ -0.32
SPC110P32380 YOL037CYOL037C 354 nt13.06□□□□□ -0.32
SPC110P32380 RTF1YGL244W 1677 nt13.02□□□□□ -0.33
SPC110P32380 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.01□□□□□ -0.33
SPC110P32380 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.99□□□□□ -0.33
SPC110P32380 BOP3YNL042W 1191 nt12.96□□□□□ -0.33
SPC110P32380 PIB2YGL023C 1908 nt12.96□□□□□ -0.34
SPC110P32380 BOR1YNL275W 1731 nt12.81□□□□□ -0.36
SPC110P32380 PTK1YKL198C 1989 nt12.75□□□□□ -0.37
SPC110P32380 YLR281CYLR281C 468 nt12.74□□□□□ -0.37
SPC110P32380 WHI5YOR083W 888 nt12.73□□□□□ -0.37
SPC110P32380 MCH5YOR306C 1566 nt12.73□□□□□ -0.37
SPC110P32380 IDH1YNL037C 1083 nt12.68□□□□□ -0.38
SPC110P32380 NCP1YHR042W 2076 nt12.67□□□□□ -0.38
SPC110P32380 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.65□□□□□ -0.38
SPC110P32380 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.65□□□□□ -0.38
SPC110P32380 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.65□□□□□ -0.38
SPC110P32380 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.65□□□□□ -0.38
SPC110P32380 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.65□□□□□ -0.38
SPC110P32380 GBP2YCL011C 1284 nt12.64□□□□□ -0.39
SPC110P32380 YFL054CYFL054C 1941 nt12.6□□□□□ -0.39
SPC110P32380 PUS2YGL063W 1113 nt12.59□□□□□ -0.39
SPC110P32380 RRD1YIL153W 1182 nt12.59□□□□□ -0.39
SPC110P32380 LCB1YMR296C 1677 nt12.58□□□□□ -0.4
SPC110P32380 FMP52YER004W 696 nt12.57□□□□□ -0.4
SPC110P32380 TCD2YKL027W 1344 nt12.57□□□□□ -0.4
SPC110P32380 IMP2'YIL154C 1041 nt12.54□□□□□ -0.4
SPC110P32380 YJL225CYJL225C 5277 nt12.52□□□□□ -0.41
SPC110P32380 SIM1YIL123W 1431 nt12.52□□□□□ -0.41
SPC110P32380 PCM1YEL058W 1674 nt12.49□□□□□ -0.41
SPC110P32380 DSK2YMR276W 1122 nt12.46□□□□□ -0.41
SPC110P32380 SPT8YLR055C 1809 nt12.46□□□□□ -0.42
SPC110P32380 DED1YOR204W 1815 nt12.46□□□□□ -0.42
SPC110P32380 CWP1YKL096W 720 nt12.41□□□□□ -0.42
SPC110P32380 YDR433WYDR433W 441 nt12.4□□□□□ -0.42
SPC110P32380 SNF6YHL025W 999 nt12.4□□□□□ -0.42
SPC110P32380 FMT1YBL013W 1206 nt12.39□□□□□ -0.43
SPC110P32380 ADH2YMR303C 1047 nt12.38□□□□□ -0.43
SPC110P32380 BIO4YNR057C 714 nt12.34□□□□□ -0.43
SPC110P32380 ALG12YNR030W 1656 nt12.34□□□□□ -0.43
SPC110P32380 YPR011CYPR011C 981 nt12.32□□□□□ -0.44
SPC110P32380 YCL042WYCL042W 360 nt12.32□□□□□ -0.44
SPC110P32380 MXR2YCL033C 507 nt12.3□□□□□ -0.44
SPC110P32380 LYS4YDR234W 2082 nt12.29□□□□□ -0.44
SPC110P32380 FMP45YDL222C 930 nt12.27□□□□□ -0.45
SPC110P32380 SOR2YDL246C 1074 nt12.25□□□□□ -0.45
SPC110P32380 SOR1YJR159W 1074 nt12.25□□□□□ -0.45
SPC110P32380 SWE1YJL187C 2460 nt12.25□□□□□ -0.45
SPC110P32380 ERF2YLR246W 1080 nt12.24□□□□□ -0.45
SPC110P32380 ERV46YAL042W 1248 nt12.19□□□□□ -0.46
SPC110P32380 YIH1YCR059C 777 nt12.18□□□□□ -0.46
SPC110P32380 YKR040CYKR040C 504 nt12.18□□□□□ -0.46
SPC110P32380 CRR1YLR213C 1269 nt12.16□□□□□ -0.46
SPC110P32380 YLL053CYLL053C 459 nt12.15□□□□□ -0.46
SPC110P32380 LPX1YOR084W 1164 nt12.15□□□□□ -0.46
SPC110P32380 RNQ1YCL028W 1218 nt12.14□□□□□ -0.47
SPC110P32380 HSP60YLR259C 1719 nt12.13□□□□□ -0.47
SPC110P32380 MOT3YMR070W 1473 nt12.12□□□□□ -0.47
SPC110P32380 FRD1YEL047C 1413 nt12.11□□□□□ -0.47
SPC110P32380 HEM12YDR047W 1089 nt12.1□□□□□ -0.47
SPC110P32380 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.08□□□□□ -0.48
SPC110P32380 YFL067WYFL067W 528 nt12.06□□□□□ -0.48
SPC110P32380 ATF2YGR177C 1608 nt12.04□□□□□ -0.48
SPC110P32380 Q0182Q0182 405 nt12.04□□□□□ -0.48
SPC110P32380 RAX1YOR301W 1308 nt12.03□□□□□ -0.48
SPC110P32380 FTR1YER145C 1215 nt12.02□□□□□ -0.49
SPC110P32380 MIC10YCL057C-A 294 nt12.02□□□□□ -0.49
SPC110P32380 DIC1YLR348C 897 nt12.01□□□□□ -0.49
SPC110P32380 DDR2YOL052C-A 186 nt12.01□□□□□ -0.49
SPC110P32380 SNG1YGR197C 1644 nt12□□□□□ -0.49
SPC110P32380 GLK1YCL040W 1503 nt11.98□□□□□ -0.49
SPC110P32380 NAR1YNL240C 1476 nt11.98□□□□□ -0.49
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