Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Hoxa11P31311 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Hoxa11P31311 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Hoxa11P31311 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Hoxa11P31311 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Hoxa11P31311 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Hoxa11P31311 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Hoxa11P31311 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Hoxa11P31311 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Hoxa11P31311 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Hoxa11P31311 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Hoxa11P31311 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Hoxa11P31311 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Hoxa11P31311 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Hoxa11P31311 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Hoxa11P31311 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Hoxa11P31311 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Hoxa11P31311 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Hoxa11P31311 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Hoxa11P31311 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Hoxa11P31311 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Hoxa11P31311 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Hoxa11P31311 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Hoxa11P31311 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Hoxa11P31311 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Hoxa11P31311 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Hoxa11P31311 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Hoxa11P31311 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Hoxa11P31311 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Hoxa11P31311 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Hoxa11P31311 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Hoxa11P31311 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Hoxa11P31311 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Hoxa11P31311 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Hoxa11P31311 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Hoxa11P31311 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Hoxa11P31311 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Hoxa11P31311 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Hoxa11P31311 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Hoxa11P31311 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Hoxa11P31311 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Hoxa11P31311 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Hoxa11P31311 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Hoxa11P31311 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Hoxa11P31311 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Hoxa11P31311 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Hoxa11P31311 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Hoxa11P31311 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Hoxa11P31311 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Hoxa11P31311 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Hoxa11P31311 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Hoxa11P31311 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Hoxa11P31311 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Hoxa11P31311 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Hoxa11P31311 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Hoxa11P31311 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Hoxa11P31311 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Hoxa11P31311 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Hoxa11P31311 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Hoxa11P31311 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Hoxa11P31311 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hoxa11P31311 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Hoxa11P31311 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Hoxa11P31311 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Hoxa11P31311 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Hoxa11P31311 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Hoxa11P31311 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Hoxa11P31311 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Hoxa11P31311 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Hoxa11P31311 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Hoxa11P31311 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Hoxa11P31311 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Hoxa11P31311 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Hoxa11P31311 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Hoxa11P31311 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Hoxa11P31311 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Hoxa11P31311 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Hoxa11P31311 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hoxa11P31311 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hoxa11P31311 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Hoxa11P31311 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Hoxa11P31311 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hoxa11P31311 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Hoxa11P31311 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Hoxa11P31311 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Hoxa11P31311 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Hoxa11P31311 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Hoxa11P31311 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Hoxa11P31311 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Hoxa11P31311 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Hoxa11P31311 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Hoxa11P31311 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Hoxa11P31311 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Hoxa11P31311 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Hoxa11P31311 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hoxa11P31311 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Hoxa11P31311 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hoxa11P31311 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hoxa11P31311 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hoxa11P31311 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms