Protein–RNA interactions for Protein: P29752

Lalba, Alpha-lactalbumin, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LalbaP29752 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LalbaP29752 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LalbaP29752 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LalbaP29752 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LalbaP29752 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LalbaP29752 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LalbaP29752 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LalbaP29752 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LalbaP29752 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LalbaP29752 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LalbaP29752 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LalbaP29752 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LalbaP29752 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LalbaP29752 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LalbaP29752 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LalbaP29752 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LalbaP29752 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LalbaP29752 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LalbaP29752 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LalbaP29752 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LalbaP29752 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LalbaP29752 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LalbaP29752 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LalbaP29752 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LalbaP29752 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LalbaP29752 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LalbaP29752 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LalbaP29752 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LalbaP29752 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LalbaP29752 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LalbaP29752 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LalbaP29752 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LalbaP29752 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LalbaP29752 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LalbaP29752 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LalbaP29752 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LalbaP29752 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LalbaP29752 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LalbaP29752 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LalbaP29752 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LalbaP29752 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LalbaP29752 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LalbaP29752 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LalbaP29752 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LalbaP29752 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LalbaP29752 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LalbaP29752 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LalbaP29752 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LalbaP29752 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LalbaP29752 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LalbaP29752 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LalbaP29752 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LalbaP29752 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LalbaP29752 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LalbaP29752 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LalbaP29752 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LalbaP29752 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LalbaP29752 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LalbaP29752 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LalbaP29752 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LalbaP29752 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LalbaP29752 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LalbaP29752 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LalbaP29752 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LalbaP29752 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LalbaP29752 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LalbaP29752 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LalbaP29752 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LalbaP29752 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LalbaP29752 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LalbaP29752 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LalbaP29752 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LalbaP29752 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LalbaP29752 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LalbaP29752 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LalbaP29752 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LalbaP29752 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LalbaP29752 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LalbaP29752 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LalbaP29752 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LalbaP29752 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LalbaP29752 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LalbaP29752 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LalbaP29752 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LalbaP29752 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LalbaP29752 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LalbaP29752 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LalbaP29752 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LalbaP29752 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LalbaP29752 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LalbaP29752 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LalbaP29752 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LalbaP29752 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LalbaP29752 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LalbaP29752 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LalbaP29752 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LalbaP29752 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LalbaP29752 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LalbaP29752 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LalbaP29752 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms