Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa3P28310 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa3P28310 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa3P28310 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa3P28310 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa3P28310 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa3P28310 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa3P28310 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa3P28310 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Defa3P28310 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa3P28310 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa3P28310 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa3P28310 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa3P28310 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa3P28310 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa3P28310 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa3P28310 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa3P28310 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa3P28310 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa3P28310 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa3P28310 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa3P28310 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa3P28310 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa3P28310 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa3P28310 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa3P28310 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa3P28310 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa3P28310 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa3P28310 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Defa3P28310 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa3P28310 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa3P28310 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa3P28310 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa3P28310 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa3P28310 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa3P28310 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa3P28310 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa3P28310 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Defa3P28310 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Defa3P28310 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Defa3P28310 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa3P28310 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa3P28310 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa3P28310 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa3P28310 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa3P28310 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Defa3P28310 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Defa3P28310 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa3P28310 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa3P28310 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Defa3P28310 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Defa3P28310 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa3P28310 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa3P28310 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa3P28310 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa3P28310 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa3P28310 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa3P28310 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa3P28310 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa3P28310 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa3P28310 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa3P28310 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa3P28310 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa3P28310 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa3P28310 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa3P28310 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa3P28310 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa3P28310 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa3P28310 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa3P28310 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa3P28310 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa3P28310 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa3P28310 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa3P28310 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa3P28310 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa3P28310 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa3P28310 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa3P28310 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa3P28310 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa3P28310 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa3P28310 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa3P28310 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa3P28310 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa3P28310 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa3P28310 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa3P28310 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa3P28310 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa3P28310 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa3P28310 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa3P28310 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa3P28310 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa3P28310 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa3P28310 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa3P28310 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa3P28310 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa3P28310 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa3P28310 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa3P28310 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa3P28310 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa3P28310 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms