Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hoxd12P23812 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hoxd12P23812 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hoxd12P23812 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hoxd12P23812 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hoxd12P23812 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hoxd12P23812 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hoxd12P23812 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hoxd12P23812 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hoxd12P23812 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hoxd12P23812 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hoxd12P23812 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hoxd12P23812 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hoxd12P23812 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxd12P23812 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hoxd12P23812 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hoxd12P23812 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Hoxd12P23812 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Hoxd12P23812 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hoxd12P23812 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Hoxd12P23812 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hoxd12P23812 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hoxd12P23812 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hoxd12P23812 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hoxd12P23812 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Hoxd12P23812 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hoxd12P23812 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hoxd12P23812 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hoxd12P23812 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hoxd12P23812 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Hoxd12P23812 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hoxd12P23812 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxd12P23812 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxd12P23812 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxd12P23812 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxd12P23812 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxd12P23812 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxd12P23812 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxd12P23812 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hoxd12P23812 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hoxd12P23812 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hoxd12P23812 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hoxd12P23812 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hoxd12P23812 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hoxd12P23812 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxd12P23812 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Hoxd12P23812 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hoxd12P23812 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxd12P23812 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxd12P23812 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Hoxd12P23812 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxd12P23812 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxd12P23812 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxd12P23812 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxd12P23812 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxd12P23812 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxd12P23812 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hoxd12P23812 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxd12P23812 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hoxd12P23812 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxd12P23812 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hoxd12P23812 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxd12P23812 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxd12P23812 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxd12P23812 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hoxd12P23812 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxd12P23812 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxd12P23812 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxd12P23812 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxd12P23812 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxd12P23812 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxd12P23812 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxd12P23812 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxd12P23812 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxd12P23812 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxd12P23812 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hoxd12P23812 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hoxd12P23812 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxd12P23812 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxd12P23812 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxd12P23812 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxd12P23812 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxd12P23812 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxd12P23812 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxd12P23812 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxd12P23812 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxd12P23812 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hoxd12P23812 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hoxd12P23812 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hoxd12P23812 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxd12P23812 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxd12P23812 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxd12P23812 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxd12P23812 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxd12P23812 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxd12P23812 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxd12P23812 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxd12P23812 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxd12P23812 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxd12P23812 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms