Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cbx3P23198 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbx3P23198 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cbx3P23198 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbx3P23198 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbx3P23198 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbx3P23198 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbx3P23198 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cbx3P23198 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cbx3P23198 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbx3P23198 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cbx3P23198 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx3P23198 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbx3P23198 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx3P23198 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx3P23198 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx3P23198 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx3P23198 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx3P23198 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cbx3P23198 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx3P23198 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cbx3P23198 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cbx3P23198 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx3P23198 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx3P23198 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx3P23198 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx3P23198 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx3P23198 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cbx3P23198 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx3P23198 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cbx3P23198 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cbx3P23198 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cbx3P23198 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cbx3P23198 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cbx3P23198 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cbx3P23198 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cbx3P23198 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cbx3P23198 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cbx3P23198 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cbx3P23198 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cbx3P23198 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cbx3P23198 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx3P23198 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cbx3P23198 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cbx3P23198 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cbx3P23198 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cbx3P23198 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cbx3P23198 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cbx3P23198 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cbx3P23198 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cbx3P23198 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cbx3P23198 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cbx3P23198 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cbx3P23198 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cbx3P23198 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cbx3P23198 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cbx3P23198 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx3P23198 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx3P23198 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx3P23198 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cbx3P23198 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cbx3P23198 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cbx3P23198 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cbx3P23198 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cbx3P23198 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cbx3P23198 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx3P23198 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx3P23198 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cbx3P23198 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx3P23198 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx3P23198 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx3P23198 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx3P23198 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cbx3P23198 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx3P23198 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx3P23198 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx3P23198 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx3P23198 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx3P23198 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx3P23198 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx3P23198 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx3P23198 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx3P23198 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx3P23198 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx3P23198 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx3P23198 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx3P23198 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cbx3P23198 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx3P23198 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx3P23198 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx3P23198 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx3P23198 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx3P23198 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx3P23198 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx3P23198 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx3P23198 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx3P23198 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx3P23198 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx3P23198 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx3P23198 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.8 ms