Protein–RNA interactions for Protein: P19807

HNM1, Choline transport protein, yeastyeast

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HNM1P19807 YOR139CYOR139C 393 nt10.89□□□□□ -0.67
HNM1P19807 YDL221WYDL221W 552 nt10.88□□□□□ -0.67
HNM1P19807 MNP1YGL068W 585 nt10.88□□□□□ -0.67
HNM1P19807 NPL3YDR432W 1245 nt10.87□□□□□ -0.67
HNM1P19807 LSM3YLR438C-A 270 nt10.86□□□□□ -0.67
HNM1P19807 SDH1YKL148C 1923 nt10.83□□□□□ -0.68
HNM1P19807 CCT6YDR188W 1641 nt10.81□□□□□ -0.68
HNM1P19807 YOL037CYOL037C 354 nt10.81□□□□□ -0.68
HNM1P19807 RKM5YLR137W 1104 nt10.8□□□□□ -0.68
HNM1P19807 SIS1YNL007C 1059 nt10.77□□□□□ -0.69
HNM1P19807 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.74□□□□□ -0.69
HNM1P19807 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.74□□□□□ -0.69
HNM1P19807 YJL225CYJL225C 5277 nt10.73□□□□□ -0.69
HNM1P19807 IRC15YPL017C 1500 nt10.72□□□□□ -0.69
HNM1P19807 SCC4YER147C 1875 nt10.71□□□□□ -0.69
HNM1P19807 GIS3YLR094C 1509 nt10.66□□□□□ -0.7
HNM1P19807 ART5YGR068C 1761 nt10.65□□□□□ -0.71
HNM1P19807 GFD2YCL036W 1701 nt10.64□□□□□ -0.71
HNM1P19807 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.6□□□□□ -0.71
HNM1P19807 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.6□□□□□ -0.71
HNM1P19807 PCH2YBR186W 1695 nt10.6□□□□□ -0.71
HNM1P19807 SEC11YIR022W 504 nt10.58□□□□□ -0.72
HNM1P19807 RTS2YOR077W 699 nt10.57□□□□□ -0.72
HNM1P19807 GUT2YIL155C 1950 nt10.56□□□□□ -0.72
HNM1P19807 PET9YBL030C 957 nt10.55□□□□□ -0.72
HNM1P19807 FRE6YLL051C 2139 nt10.54□□□□□ -0.72
HNM1P19807 YLR281CYLR281C 468 nt10.5□□□□□ -0.73
HNM1P19807 YSC84YHR016C 1407 nt10.5□□□□□ -0.73
HNM1P19807 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.47□□□□□ -0.73
HNM1P19807 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.47□□□□□ -0.73
HNM1P19807 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.47□□□□□ -0.73
HNM1P19807 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.47□□□□□ -0.73
HNM1P19807 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.47□□□□□ -0.73
HNM1P19807 YCH1YGR203W 447 nt10.47□□□□□ -0.73
HNM1P19807 TIR4YOR009W 1464 nt10.47□□□□□ -0.73
HNM1P19807 CUE1YMR264W 612 nt10.46□□□□□ -0.73
HNM1P19807 WHI5YOR083W 888 nt10.46□□□□□ -0.73
HNM1P19807 YHL050CYHL050C 2094 nt10.45□□□□□ -0.74
HNM1P19807 PUS2YGL063W 1113 nt10.43□□□□□ -0.74
HNM1P19807 YMR057CYMR057C 372 nt10.42□□□□□ -0.74
HNM1P19807 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.41□□□□□ -0.74
HNM1P19807 RRT12YCR045C 1476 nt10.4□□□□□ -0.74
HNM1P19807 PIB2YGL023C 1908 nt10.4□□□□□ -0.74
HNM1P19807 SSN3YPL042C 1668 nt10.4□□□□□ -0.74
HNM1P19807 YIL100WYIL100W 354 nt10.33□□□□□ -0.76
HNM1P19807 YJL152WYJL152W 360 nt10.32□□□□□ -0.76
HNM1P19807 YNL195CYNL195C 786 nt10.32□□□□□ -0.76
HNM1P19807 RTF1YGL244W 1677 nt10.31□□□□□ -0.76
HNM1P19807 IMP2'YIL154C 1041 nt10.31□□□□□ -0.76
HNM1P19807 MCH5YOR306C 1566 nt10.28□□□□□ -0.76
HNM1P19807 YLR236CYLR236C 324 nt10.27□□□□□ -0.77
HNM1P19807 DSK2YMR276W 1122 nt10.27□□□□□ -0.77
HNM1P19807 BOP3YNL042W 1191 nt10.24□□□□□ -0.77
HNM1P19807 IDH1YNL037C 1083 nt10.19□□□□□ -0.78
HNM1P19807 PTK1YKL198C 1989 nt10.18□□□□□ -0.78
HNM1P19807 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.18□□□□□ -0.78
HNM1P19807 FMP45YDL222C 930 nt10.15□□□□□ -0.78
HNM1P19807 NCP1YHR042W 2076 nt10.13□□□□□ -0.79
HNM1P19807 YPR011CYPR011C 981 nt10.12□□□□□ -0.79
HNM1P19807 BSP1YPR171W 1731 nt10.12□□□□□ -0.79
HNM1P19807 GID7YCL039W 2238 nt10.07□□□□□ -0.8
HNM1P19807 GBP2YCL011C 1284 nt10.06□□□□□ -0.8
HNM1P19807 YDR433WYDR433W 441 nt10.03□□□□□ -0.8
HNM1P19807 ERV46YAL042W 1248 nt10.02□□□□□ -0.81
HNM1P19807 BOR1YNL275W 1731 nt10.02□□□□□ -0.81
HNM1P19807 LCB1YMR296C 1677 nt10.01□□□□□ -0.81
HNM1P19807 LPX1YOR084W 1164 nt9.99□□□□□ -0.81
HNM1P19807 YFL054CYFL054C 1941 nt9.97□□□□□ -0.81
HNM1P19807 RRD1YIL153W 1182 nt9.97□□□□□ -0.81
HNM1P19807 YKR040CYKR040C 504 nt9.96□□□□□ -0.82
HNM1P19807 TCD2YKL027W 1344 nt9.96□□□□□ -0.82
HNM1P19807 UBX6YJL048C 1191 nt9.92□□□□□ -0.82
HNM1P19807 DED1YOR204W 1815 nt9.9□□□□□ -0.82
HNM1P19807 SPT8YLR055C 1809 nt9.89□□□□□ -0.83
HNM1P19807 ESBP6YNL125C 2022 nt9.89□□□□□ -0.83
HNM1P19807 FMP52YER004W 696 nt9.89□□□□□ -0.83
HNM1P19807 MXR2YCL033C 507 nt9.88□□□□□ -0.83
HNM1P19807 PCM1YEL058W 1674 nt9.87□□□□□ -0.83
HNM1P19807 SIM1YIL123W 1431 nt9.86□□□□□ -0.83
HNM1P19807 FMT1YBL013W 1206 nt9.85□□□□□ -0.83
HNM1P19807 NPP1YCR026C 2229 nt9.81□□□□□ -0.84
HNM1P19807 LYS4YDR234W 2082 nt9.81□□□□□ -0.84
HNM1P19807 ADH2YMR303C 1047 nt9.79□□□□□ -0.84
HNM1P19807 MRPL8YJL063C 717 nt9.78□□□□□ -0.84
HNM1P19807 CWP1YKL096W 720 nt9.78□□□□□ -0.84
HNM1P19807 SPP1YPL138C 1062 nt9.78□□□□□ -0.84
HNM1P19807 YCL042WYCL042W 360 nt9.78□□□□□ -0.84
HNM1P19807 BIO4YNR057C 714 nt9.76□□□□□ -0.85
HNM1P19807 MET2YNL277W 1461 nt9.75□□□□□ -0.85
HNM1P19807 SNF6YHL025W 999 nt9.75□□□□□ -0.85
HNM1P19807 SFP1YLR403W 2052 nt9.73□□□□□ -0.85
HNM1P19807 SWE1YJL187C 2460 nt9.73□□□□□ -0.85
HNM1P19807 YAT1YAR035W 2064 nt9.73□□□□□ -0.85
HNM1P19807 FRD1YEL047C 1413 nt9.73□□□□□ -0.85
HNM1P19807 SOR2YDL246C 1074 nt9.71□□□□□ -0.86
HNM1P19807 SOR1YJR159W 1074 nt9.71□□□□□ -0.86
HNM1P19807 ADO1YJR105W 1023 nt9.69□□□□□ -0.86
HNM1P19807 DTR1YBR180W 1719 nt9.69□□□□□ -0.86
HNM1P19807 ILV2YMR108W 2064 nt9.68□□□□□ -0.86
HNM1P19807 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.9 ms