Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NefhP19246 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NefhP19246 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NefhP19246 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NefhP19246 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NefhP19246 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
NefhP19246 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NefhP19246 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NefhP19246 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
NefhP19246 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NefhP19246 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NefhP19246 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NefhP19246 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NefhP19246 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NefhP19246 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NefhP19246 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NefhP19246 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NefhP19246 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NefhP19246 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
NefhP19246 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NefhP19246 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NefhP19246 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NefhP19246 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NefhP19246 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NefhP19246 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NefhP19246 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NefhP19246 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NefhP19246 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NefhP19246 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NefhP19246 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NefhP19246 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NefhP19246 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NefhP19246 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NefhP19246 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NefhP19246 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NefhP19246 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NefhP19246 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NefhP19246 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NefhP19246 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
NefhP19246 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NefhP19246 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NefhP19246 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NefhP19246 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NefhP19246 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
NefhP19246 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NefhP19246 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NefhP19246 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NefhP19246 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NefhP19246 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NefhP19246 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NefhP19246 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NefhP19246 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NefhP19246 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NefhP19246 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NefhP19246 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NefhP19246 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NefhP19246 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NefhP19246 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NefhP19246 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NefhP19246 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NefhP19246 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NefhP19246 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NefhP19246 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
NefhP19246 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NefhP19246 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NefhP19246 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NefhP19246 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NefhP19246 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NefhP19246 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NefhP19246 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NefhP19246 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NefhP19246 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
NefhP19246 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NefhP19246 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NefhP19246 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NefhP19246 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NefhP19246 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
NefhP19246 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NefhP19246 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NefhP19246 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NefhP19246 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NefhP19246 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NefhP19246 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NefhP19246 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NefhP19246 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NefhP19246 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NefhP19246 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NefhP19246 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NefhP19246 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NefhP19246 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NefhP19246 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NefhP19246 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NefhP19246 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NefhP19246 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
NefhP19246 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NefhP19246 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NefhP19246 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
NefhP19246 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NefhP19246 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NefhP19246 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms