Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lama1P19137 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lama1P19137 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lama1P19137 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Lama1P19137 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lama1P19137 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lama1P19137 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lama1P19137 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lama1P19137 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lama1P19137 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Lama1P19137 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lama1P19137 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lama1P19137 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lama1P19137 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lama1P19137 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lama1P19137 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lama1P19137 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lama1P19137 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lama1P19137 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lama1P19137 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lama1P19137 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lama1P19137 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lama1P19137 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Lama1P19137 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lama1P19137 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lama1P19137 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lama1P19137 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Lama1P19137 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lama1P19137 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lama1P19137 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lama1P19137 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lama1P19137 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Lama1P19137 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lama1P19137 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lama1P19137 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Lama1P19137 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lama1P19137 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lama1P19137 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lama1P19137 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lama1P19137 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lama1P19137 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lama1P19137 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lama1P19137 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lama1P19137 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lama1P19137 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lama1P19137 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Lama1P19137 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lama1P19137 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lama1P19137 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lama1P19137 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lama1P19137 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lama1P19137 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lama1P19137 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lama1P19137 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lama1P19137 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lama1P19137 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lama1P19137 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lama1P19137 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lama1P19137 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lama1P19137 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Lama1P19137 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lama1P19137 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lama1P19137 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lama1P19137 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lama1P19137 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Lama1P19137 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lama1P19137 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lama1P19137 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lama1P19137 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lama1P19137 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lama1P19137 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lama1P19137 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lama1P19137 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lama1P19137 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lama1P19137 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lama1P19137 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lama1P19137 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lama1P19137 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Lama1P19137 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lama1P19137 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lama1P19137 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Lama1P19137 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lama1P19137 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lama1P19137 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lama1P19137 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lama1P19137 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lama1P19137 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Lama1P19137 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lama1P19137 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lama1P19137 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lama1P19137 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lama1P19137 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lama1P19137 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lama1P19137 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lama1P19137 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lama1P19137 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lama1P19137 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lama1P19137 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Lama1P19137 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lama1P19137 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms