Protein–RNA interactions for Protein: P17950

Ier2, Immediate early response gene 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ier2P17950 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ier2P17950 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ier2P17950 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ier2P17950 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ier2P17950 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ier2P17950 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ier2P17950 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ier2P17950 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ier2P17950 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ier2P17950 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ier2P17950 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ier2P17950 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ier2P17950 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ier2P17950 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ier2P17950 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ier2P17950 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ier2P17950 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ier2P17950 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ier2P17950 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ier2P17950 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ier2P17950 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ier2P17950 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ier2P17950 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ier2P17950 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ier2P17950 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ier2P17950 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ier2P17950 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ier2P17950 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ier2P17950 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ier2P17950 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ier2P17950 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ier2P17950 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ier2P17950 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ier2P17950 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ier2P17950 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ier2P17950 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ier2P17950 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ier2P17950 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ier2P17950 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ier2P17950 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ier2P17950 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ier2P17950 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Ier2P17950 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ier2P17950 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ier2P17950 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ier2P17950 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ier2P17950 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ier2P17950 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ier2P17950 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ier2P17950 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ier2P17950 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ier2P17950 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ier2P17950 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ier2P17950 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ier2P17950 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ier2P17950 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ier2P17950 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ier2P17950 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ier2P17950 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ier2P17950 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ier2P17950 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ier2P17950 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ier2P17950 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ier2P17950 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ier2P17950 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ier2P17950 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ier2P17950 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ier2P17950 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ier2P17950 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ier2P17950 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ier2P17950 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ier2P17950 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ier2P17950 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ier2P17950 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ier2P17950 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ier2P17950 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ier2P17950 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ier2P17950 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ier2P17950 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ier2P17950 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ier2P17950 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ier2P17950 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ier2P17950 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ier2P17950 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ier2P17950 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ier2P17950 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ier2P17950 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ier2P17950 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ier2P17950 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ier2P17950 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ier2P17950 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ier2P17950 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ier2P17950 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ier2P17950 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ier2P17950 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ier2P17950 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ier2P17950 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ier2P17950 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ier2P17950 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ier2P17950 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms