Protein–RNA interactions for Protein: P14693

SAM35, Sorting assembly machinery 35 kDa subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SAM35P14693 SHU1YHL006C 453 nt11.42□□□□□ -0.58
SAM35P14693 HOM6YJR139C 1080 nt11.4□□□□□ -0.58
SAM35P14693 GFD2YCL036W 1701 nt11.38□□□□□ -0.59
SAM35P14693 GIS3YLR094C 1509 nt11.38□□□□□ -0.59
SAM35P14693 ART5YGR068C 1761 nt11.37□□□□□ -0.59
SAM35P14693 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.35□□□□□ -0.59
SAM35P14693 PCH2YBR186W 1695 nt11.3□□□□□ -0.6
SAM35P14693 MNP1YGL068W 585 nt11.29□□□□□ -0.6
SAM35P14693 SEC11YIR022W 504 nt11.29□□□□□ -0.6
SAM35P14693 RTS2YOR077W 699 nt11.29□□□□□ -0.6
SAM35P14693 PET9YBL030C 957 nt11.28□□□□□ -0.6
SAM35P14693 GUT2YIL155C 1950 nt11.26□□□□□ -0.61
SAM35P14693 RKM5YLR137W 1104 nt11.23□□□□□ -0.61
SAM35P14693 TIR4YOR009W 1464 nt11.21□□□□□ -0.61
SAM35P14693 YCH1YGR203W 447 nt11.21□□□□□ -0.61
SAM35P14693 YSC84YHR016C 1407 nt11.2□□□□□ -0.62
SAM35P14693 CUE1YMR264W 612 nt11.18□□□□□ -0.62
SAM35P14693 YHL050CYHL050C 2094 nt11.15□□□□□ -0.63
SAM35P14693 PAC11YDR488C 1602 nt11.11□□□□□ -0.63
SAM35P14693 YKL097CYKL097C 411 nt11.11□□□□□ -0.63
SAM35P14693 YMR057CYMR057C 372 nt11.11□□□□□ -0.63
SAM35P14693 PIB2YGL023C 1908 nt11.1□□□□□ -0.63
SAM35P14693 RRT12YCR045C 1476 nt11.07□□□□□ -0.64
SAM35P14693 NPL3YDR432W 1245 nt11.06□□□□□ -0.64
SAM35P14693 FPS1YLL043W 2010 nt11.06□□□□□ -0.64
SAM35P14693 YGR139WYGR139W 339 nt11.05□□□□□ -0.64
SAM35P14693 YIL100WYIL100W 354 nt11.03□□□□□ -0.64
SAM35P14693 YNL195CYNL195C 786 nt11.01□□□□□ -0.65
SAM35P14693 RTF1YGL244W 1677 nt11□□□□□ -0.65
SAM35P14693 NME1NME1 340 nt10.98□□□□□ -0.65
SAM35P14693 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.97□□□□□ -0.65
SAM35P14693 YLR236CYLR236C 324 nt10.96□□□□□ -0.65
SAM35P14693 YJL152WYJL152W 360 nt10.95□□□□□ -0.66
SAM35P14693 YOL037CYOL037C 354 nt10.94□□□□□ -0.66
SAM35P14693 BOP3YNL042W 1191 nt10.93□□□□□ -0.66
SAM35P14693 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.89□□□□□ -0.67
SAM35P14693 PTK1YKL198C 1989 nt10.85□□□□□ -0.67
SAM35P14693 NCP1YHR042W 2076 nt10.83□□□□□ -0.68
SAM35P14693 YOR139CYOR139C 393 nt10.76□□□□□ -0.69
SAM35P14693 WHI5YOR083W 888 nt10.73□□□□□ -0.69
SAM35P14693 YLR281CYLR281C 468 nt10.71□□□□□ -0.69
SAM35P14693 LCB1YMR296C 1677 nt10.69□□□□□ -0.7
SAM35P14693 RRD1YIL153W 1182 nt10.68□□□□□ -0.7
SAM35P14693 NVJ2YPR091C 2313 nt10.66□□□□□ -0.7
SAM35P14693 IDH1YNL037C 1083 nt10.64□□□□□ -0.71
SAM35P14693 GBP2YCL011C 1284 nt10.62□□□□□ -0.71
SAM35P14693 YFL054CYFL054C 1941 nt10.61□□□□□ -0.71
SAM35P14693 FMP52YER004W 696 nt10.61□□□□□ -0.71
SAM35P14693 DED1YOR204W 1815 nt10.61□□□□□ -0.71
SAM35P14693 SPT8YLR055C 1809 nt10.56□□□□□ -0.72
SAM35P14693 TCD2YKL027W 1344 nt10.56□□□□□ -0.72
SAM35P14693 PCM1YEL058W 1674 nt10.55□□□□□ -0.72
SAM35P14693 YJL225CYJL225C 5277 nt10.54□□□□□ -0.72
SAM35P14693 FMT1YBL013W 1206 nt10.53□□□□□ -0.72
SAM35P14693 SIM1YIL123W 1431 nt10.52□□□□□ -0.73
SAM35P14693 IMP2'YIL154C 1041 nt10.5□□□□□ -0.73
SAM35P14693 LYS4YDR234W 2082 nt10.49□□□□□ -0.73
SAM35P14693 DSK2YMR276W 1122 nt10.47□□□□□ -0.73
SAM35P14693 ADH2YMR303C 1047 nt10.46□□□□□ -0.73
SAM35P14693 PUS2YGL063W 1113 nt10.45□□□□□ -0.74
SAM35P14693 BIO4YNR057C 714 nt10.45□□□□□ -0.74
SAM35P14693 CWP1YKL096W 720 nt10.44□□□□□ -0.74
SAM35P14693 SNF6YHL025W 999 nt10.43□□□□□ -0.74
SAM35P14693 YDR433WYDR433W 441 nt10.41□□□□□ -0.74
SAM35P14693 MXR2YCL033C 507 nt10.41□□□□□ -0.74
SAM35P14693 SOR2YDL246C 1074 nt10.4□□□□□ -0.74
SAM35P14693 SOR1YJR159W 1074 nt10.4□□□□□ -0.74
SAM35P14693 FMP45YDL222C 930 nt10.39□□□□□ -0.75
SAM35P14693 YPR011CYPR011C 981 nt10.39□□□□□ -0.75
SAM35P14693 SWE1YJL187C 2460 nt10.39□□□□□ -0.75
SAM35P14693 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.37□□□□□ -0.75
SAM35P14693 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.37□□□□□ -0.75
SAM35P14693 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.37□□□□□ -0.75
SAM35P14693 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.37□□□□□ -0.75
SAM35P14693 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.37□□□□□ -0.75
SAM35P14693 ERV46YAL042W 1248 nt10.33□□□□□ -0.76
SAM35P14693 BOR1YNL275W 1731 nt10.33□□□□□ -0.76
SAM35P14693 YCL042WYCL042W 360 nt10.32□□□□□ -0.76
SAM35P14693 YIH1YCR059C 777 nt10.31□□□□□ -0.76
SAM35P14693 CRR1YLR213C 1269 nt10.31□□□□□ -0.76
SAM35P14693 ERF2YLR246W 1080 nt10.31□□□□□ -0.76
SAM35P14693 LPX1YOR084W 1164 nt10.3□□□□□ -0.76
SAM35P14693 FRD1YEL047C 1413 nt10.28□□□□□ -0.76
SAM35P14693 YKR040CYKR040C 504 nt10.27□□□□□ -0.77
SAM35P14693 RNQ1YCL028W 1218 nt10.26□□□□□ -0.77
SAM35P14693 YLL053CYLL053C 459 nt10.25□□□□□ -0.77
SAM35P14693 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.23□□□□□ -0.77
SAM35P14693 ATF2YGR177C 1608 nt10.2□□□□□ -0.78
SAM35P14693 HSP60YLR259C 1719 nt10.19□□□□□ -0.78
SAM35P14693 CSM2YIL132C 642 nt10.19□□□□□ -0.78
SAM35P14693 MIC10YCL057C-A 294 nt10.19□□□□□ -0.78
SAM35P14693 HEM12YDR047W 1089 nt10.18□□□□□ -0.78
SAM35P14693 FTR1YER145C 1215 nt10.16□□□□□ -0.78
SAM35P14693 SNG1YGR197C 1644 nt10.15□□□□□ -0.78
SAM35P14693 YFL067WYFL067W 528 nt10.14□□□□□ -0.79
SAM35P14693 DIC1YLR348C 897 nt10.14□□□□□ -0.79
SAM35P14693 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.12□□□□□ -0.79
SAM35P14693 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.12□□□□□ -0.79
SAM35P14693 GAL1YBR020W 1587 nt10.12□□□□□ -0.79
SAM35P14693 RAX1YOR301W 1308 nt10.11□□□□□ -0.79
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