Protein–RNA interactions for Protein: P14242

PMS1, DNA mismatch repair protein PMS1, yeastyeast

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PMS1P14242 YOR139CYOR139C 393 nt12.88□□□□□ -0.35
PMS1P14242 YDL221WYDL221W 552 nt12.85□□□□□ -0.35
PMS1P14242 ART5YGR068C 1761 nt12.81□□□□□ -0.36
PMS1P14242 GFD2YCL036W 1701 nt12.77□□□□□ -0.36
PMS1P14242 YBR220CYBR220C 1683 nt12.76□□□□□ -0.37
PMS1P14242 PET9YBL030C 957 nt12.75□□□□□ -0.37
PMS1P14242 SDH1YKL148C 1923 nt12.73□□□□□ -0.37
PMS1P14242 YCH1YGR203W 447 nt12.73□□□□□ -0.37
PMS1P14242 TIR4YOR009W 1464 nt12.72□□□□□ -0.37
PMS1P14242 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.71□□□□□ -0.37
PMS1P14242 IRC15YPL017C 1500 nt12.71□□□□□ -0.38
PMS1P14242 BDF1YLR399C 2061 nt12.68□□□□□ -0.38
PMS1P14242 YJL152WYJL152W 360 nt12.67□□□□□ -0.38
PMS1P14242 RTS2YOR077W 699 nt12.65□□□□□ -0.38
PMS1P14242 SCC4YER147C 1875 nt12.64□□□□□ -0.39
PMS1P14242 GIS3YLR094C 1509 nt12.62□□□□□ -0.39
PMS1P14242 YMR057CYMR057C 372 nt12.62□□□□□ -0.39
PMS1P14242 WHI5YOR083W 888 nt12.61□□□□□ -0.39
PMS1P14242 YLR281CYLR281C 468 nt12.6□□□□□ -0.39
PMS1P14242 CUE1YMR264W 612 nt12.54□□□□□ -0.4
PMS1P14242 TAT1YBR069C 1860 nt12.53□□□□□ -0.4
PMS1P14242 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.5□□□□□ -0.41
PMS1P14242 FPS1YLL043W 2010 nt12.45□□□□□ -0.42
PMS1P14242 PUS2YGL063W 1113 nt12.45□□□□□ -0.42
PMS1P14242 YIL100WYIL100W 354 nt12.43□□□□□ -0.42
PMS1P14242 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.41□□□□□ -0.42
PMS1P14242 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.41□□□□□ -0.42
PMS1P14242 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.41□□□□□ -0.42
PMS1P14242 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.41□□□□□ -0.42
PMS1P14242 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.41□□□□□ -0.42
PMS1P14242 YLR236CYLR236C 324 nt12.41□□□□□ -0.42
PMS1P14242 IDH1YNL037C 1083 nt12.39□□□□□ -0.43
PMS1P14242 IMP2'YIL154C 1041 nt12.38□□□□□ -0.43
PMS1P14242 SEC11YIR022W 504 nt12.37□□□□□ -0.43
PMS1P14242 DSK2YMR276W 1122 nt12.34□□□□□ -0.43
PMS1P14242 YNL195CYNL195C 786 nt12.34□□□□□ -0.43
PMS1P14242 YSC84YHR016C 1407 nt12.34□□□□□ -0.43
PMS1P14242 GBP2YCL011C 1284 nt12.3□□□□□ -0.44
PMS1P14242 PCH2YBR186W 1695 nt12.29□□□□□ -0.44
PMS1P14242 RRT12YCR045C 1476 nt12.26□□□□□ -0.45
PMS1P14242 YHL050CYHL050C 2094 nt12.25□□□□□ -0.45
PMS1P14242 TCD2YKL027W 1344 nt12.2□□□□□ -0.46
PMS1P14242 GUT2YIL155C 1950 nt12.2□□□□□ -0.46
PMS1P14242 YPR011CYPR011C 981 nt12.19□□□□□ -0.46
PMS1P14242 MOT3YMR070W 1473 nt12.19□□□□□ -0.46
PMS1P14242 YDR433WYDR433W 441 nt12.18□□□□□ -0.46
PMS1P14242 RRD1YIL153W 1182 nt12.17□□□□□ -0.46
PMS1P14242 NVJ2YPR091C 2313 nt12.17□□□□□ -0.46
PMS1P14242 FMP45YDL222C 930 nt12.13□□□□□ -0.47
PMS1P14242 DED1YOR204W 1815 nt12.11□□□□□ -0.47
PMS1P14242 FMP52YER004W 696 nt12.09□□□□□ -0.47
PMS1P14242 ERV46YAL042W 1248 nt12.08□□□□□ -0.48
PMS1P14242 MXR2YCL033C 507 nt12.08□□□□□ -0.48
PMS1P14242 LPX1YOR084W 1164 nt12.07□□□□□ -0.48
PMS1P14242 PAC11YDR488C 1602 nt12.07□□□□□ -0.48
PMS1P14242 YKR040CYKR040C 504 nt12.03□□□□□ -0.48
PMS1P14242 FMT1YBL013W 1206 nt12.01□□□□□ -0.49
PMS1P14242 RTF1YGL244W 1677 nt12□□□□□ -0.49
PMS1P14242 BOP3YNL042W 1191 nt11.99□□□□□ -0.49
PMS1P14242 YCL042WYCL042W 360 nt11.97□□□□□ -0.49
PMS1P14242 PIB2YGL023C 1908 nt11.97□□□□□ -0.49
PMS1P14242 PCM1YEL058W 1674 nt11.96□□□□□ -0.5
PMS1P14242 CWP1YKL096W 720 nt11.95□□□□□ -0.5
PMS1P14242 SOR2YDL246C 1074 nt11.93□□□□□ -0.5
PMS1P14242 SOR1YJR159W 1074 nt11.93□□□□□ -0.5
PMS1P14242 ADH2YMR303C 1047 nt11.92□□□□□ -0.5
PMS1P14242 SNF6YHL025W 999 nt11.9□□□□□ -0.5
PMS1P14242 FRD1YEL047C 1413 nt11.88□□□□□ -0.51
PMS1P14242 NCP1YHR042W 2076 nt11.88□□□□□ -0.51
PMS1P14242 LCB1YMR296C 1677 nt11.87□□□□□ -0.51
PMS1P14242 SIM1YIL123W 1431 nt11.86□□□□□ -0.51
PMS1P14242 PTK1YKL198C 1989 nt11.78□□□□□ -0.52
PMS1P14242 BIO4YNR057C 714 nt11.78□□□□□ -0.52
PMS1P14242 SPP1YPL138C 1062 nt11.74□□□□□ -0.53
PMS1P14242 YIH1YCR059C 777 nt11.73□□□□□ -0.53
PMS1P14242 RNQ1YCL028W 1218 nt11.72□□□□□ -0.53
PMS1P14242 DIC1YLR348C 897 nt11.67□□□□□ -0.54
PMS1P14242 YLL053CYLL053C 459 nt11.66□□□□□ -0.54
PMS1P14242 PTH1YHR189W 573 nt11.65□□□□□ -0.54
PMS1P14242 YLR235CYLR235C 399 nt11.64□□□□□ -0.55
PMS1P14242 ERF2YLR246W 1080 nt11.64□□□□□ -0.55
PMS1P14242 YFL054CYFL054C 1941 nt11.63□□□□□ -0.55
PMS1P14242 LYS4YDR234W 2082 nt11.61□□□□□ -0.55
PMS1P14242 FTR1YER145C 1215 nt11.57□□□□□ -0.56
PMS1P14242 CRR1YLR213C 1269 nt11.57□□□□□ -0.56
PMS1P14242 TIM23YNR017W 669 nt11.54□□□□□ -0.56
PMS1P14242 YJL225CYJL225C 5277 nt11.53□□□□□ -0.56
PMS1P14242 YFL067WYFL067W 528 nt11.52□□□□□ -0.57
PMS1P14242 GAL1YBR020W 1587 nt11.52□□□□□ -0.57
PMS1P14242 ATF2YGR177C 1608 nt11.52□□□□□ -0.57
PMS1P14242 TRM5YHR070W 1500 nt11.51□□□□□ -0.57
PMS1P14242 YKL030WYKL030W 606 nt11.51□□□□□ -0.57
PMS1P14242 SPT8YLR055C 1809 nt11.5□□□□□ -0.57
PMS1P14242 HEM12YDR047W 1089 nt11.49□□□□□ -0.57
PMS1P14242 YLR179CYLR179C 606 nt11.49□□□□□ -0.57
PMS1P14242 DDR2YOL052C-A 186 nt11.49□□□□□ -0.57
PMS1P14242 AQY1YPR192W 918 nt11.48□□□□□ -0.57
PMS1P14242 RTG1YOL067C 534 nt11.43□□□□□ -0.58
PMS1P14242 MIC10YCL057C-A 294 nt11.43□□□□□ -0.58
PMS1P14242 SNG1YGR197C 1644 nt11.42□□□□□ -0.58
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