Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chrm1P12657 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chrm1P12657 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chrm1P12657 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chrm1P12657 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Chrm1P12657 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chrm1P12657 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chrm1P12657 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chrm1P12657 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chrm1P12657 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Chrm1P12657 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chrm1P12657 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chrm1P12657 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chrm1P12657 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chrm1P12657 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chrm1P12657 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chrm1P12657 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chrm1P12657 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chrm1P12657 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chrm1P12657 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Chrm1P12657 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chrm1P12657 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chrm1P12657 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chrm1P12657 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chrm1P12657 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chrm1P12657 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Chrm1P12657 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chrm1P12657 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chrm1P12657 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Chrm1P12657 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chrm1P12657 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Chrm1P12657 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chrm1P12657 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Chrm1P12657 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chrm1P12657 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chrm1P12657 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chrm1P12657 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chrm1P12657 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chrm1P12657 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chrm1P12657 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chrm1P12657 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chrm1P12657 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chrm1P12657 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Chrm1P12657 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chrm1P12657 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chrm1P12657 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chrm1P12657 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chrm1P12657 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chrm1P12657 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chrm1P12657 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chrm1P12657 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Chrm1P12657 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chrm1P12657 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chrm1P12657 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chrm1P12657 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chrm1P12657 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chrm1P12657 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chrm1P12657 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chrm1P12657 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chrm1P12657 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chrm1P12657 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Chrm1P12657 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chrm1P12657 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chrm1P12657 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chrm1P12657 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chrm1P12657 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chrm1P12657 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chrm1P12657 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chrm1P12657 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chrm1P12657 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Chrm1P12657 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chrm1P12657 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chrm1P12657 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chrm1P12657 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chrm1P12657 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Chrm1P12657 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chrm1P12657 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chrm1P12657 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chrm1P12657 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Chrm1P12657 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chrm1P12657 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chrm1P12657 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chrm1P12657 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chrm1P12657 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chrm1P12657 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chrm1P12657 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Chrm1P12657 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chrm1P12657 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chrm1P12657 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chrm1P12657 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Chrm1P12657 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Chrm1P12657 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chrm1P12657 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chrm1P12657 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chrm1P12657 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chrm1P12657 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chrm1P12657 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chrm1P12657 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chrm1P12657 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chrm1P12657 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms