Protein–RNA interactions for Protein: P0CX85

RPL35B, 60S ribosomal protein L35-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL35BP0CX85 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.71□□□□□ -0.7
RPL35BP0CX85 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.71□□□□□ -0.7
RPL35BP0CX85 SIS1YNL007C 1059 nt10.68□□□□□ -0.7
RPL35BP0CX85 MEP2YNL142W 1500 nt10.66□□□□□ -0.7
RPL35BP0CX85 PUS2YGL063W 1113 nt10.65□□□□□ -0.7
RPL35BP0CX85 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.65□□□□□ -0.7
RPL35BP0CX85 Q0182Q0182 405 nt10.64□□□□□ -0.71
RPL35BP0CX85 PAC11YDR488C 1602 nt10.64□□□□□ -0.71
RPL35BP0CX85 YJL225CYJL225C 5277 nt10.64□□□□□ -0.71
RPL35BP0CX85 IMP2'YIL154C 1041 nt10.63□□□□□ -0.71
RPL35BP0CX85 RPP2AYOL039W 321 nt10.62□□□□□ -0.71
RPL35BP0CX85 YCH1YGR203W 447 nt10.55□□□□□ -0.72
RPL35BP0CX85 DSK2YMR276W 1122 nt10.51□□□□□ -0.73
RPL35BP0CX85 PTP1YDL230W 1008 nt10.5□□□□□ -0.73
RPL35BP0CX85 YJL152WYJL152W 360 nt10.48□□□□□ -0.73
RPL35BP0CX85 PET9YBL030C 957 nt10.47□□□□□ -0.73
RPL35BP0CX85 TIR4YOR009W 1464 nt10.42□□□□□ -0.74
RPL35BP0CX85 IDH1YNL037C 1083 nt10.41□□□□□ -0.74
RPL35BP0CX85 ART5YGR068C 1761 nt10.41□□□□□ -0.74
RPL35BP0CX85 DCW1YKL046C 1350 nt10.39□□□□□ -0.75
RPL35BP0CX85 YMR090WYMR090W 684 nt10.39□□□□□ -0.75
RPL35BP0CX85 CAC2YML102W 1407 nt10.37□□□□□ -0.75
RPL35BP0CX85 GFD2YCL036W 1701 nt10.37□□□□□ -0.75
RPL35BP0CX85 FMP45YDL222C 930 nt10.36□□□□□ -0.75
RPL35BP0CX85 EMI2YDR516C 1503 nt10.36□□□□□ -0.75
RPL35BP0CX85 YLR236CYLR236C 324 nt10.35□□□□□ -0.75
RPL35BP0CX85 YPR011CYPR011C 981 nt10.34□□□□□ -0.75
RPL35BP0CX85 MOT3YMR070W 1473 nt10.34□□□□□ -0.75
RPL35BP0CX85 YMR057CYMR057C 372 nt10.31□□□□□ -0.76
RPL35BP0CX85 YDL221WYDL221W 552 nt10.3□□□□□ -0.76
RPL35BP0CX85 ERV46YAL042W 1248 nt10.3□□□□□ -0.76
RPL35BP0CX85 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.3□□□□□ -0.76
RPL35BP0CX85 SSA4YER103W 1929 nt10.29□□□□□ -0.76
RPL35BP0CX85 GBP2YCL011C 1284 nt10.26□□□□□ -0.77
RPL35BP0CX85 IRC15YPL017C 1500 nt10.22□□□□□ -0.77
RPL35BP0CX85 YDR433WYDR433W 441 nt10.21□□□□□ -0.77
RPL35BP0CX85 YKR040CYKR040C 504 nt10.21□□□□□ -0.77
RPL35BP0CX85 CUE1YMR264W 612 nt10.2□□□□□ -0.78
RPL35BP0CX85 LPX1YOR084W 1164 nt10.19□□□□□ -0.78
RPL35BP0CX85 TCD2YKL027W 1344 nt10.18□□□□□ -0.78
RPL35BP0CX85 SDH1YKL148C 1923 nt10.15□□□□□ -0.78
RPL35BP0CX85 RTS2YOR077W 699 nt10.15□□□□□ -0.78
RPL35BP0CX85 GIS3YLR094C 1509 nt10.14□□□□□ -0.79
RPL35BP0CX85 SCC4YER147C 1875 nt10.11□□□□□ -0.79
RPL35BP0CX85 YBR220CYBR220C 1683 nt10.11□□□□□ -0.79
RPL35BP0CX85 MRPL8YJL063C 717 nt10.1□□□□□ -0.79
RPL35BP0CX85 YIL100WYIL100W 354 nt10.09□□□□□ -0.79
RPL35BP0CX85 RRD1YIL153W 1182 nt10.06□□□□□ -0.8
RPL35BP0CX85 FMP52YER004W 696 nt10.05□□□□□ -0.8
RPL35BP0CX85 MXR2YCL033C 507 nt10.05□□□□□ -0.8
RPL35BP0CX85 DED1YOR204W 1815 nt10.03□□□□□ -0.8
RPL35BP0CX85 ADO1YJR105W 1023 nt9.99□□□□□ -0.81
RPL35BP0CX85 SOR2YDL246C 1074 nt9.98□□□□□ -0.81
RPL35BP0CX85 SOR1YJR159W 1074 nt9.98□□□□□ -0.81
RPL35BP0CX85 YCL042WYCL042W 360 nt9.98□□□□□ -0.81
RPL35BP0CX85 BDF1YLR399C 2061 nt9.98□□□□□ -0.81
RPL35BP0CX85 SPP1YPL138C 1062 nt9.96□□□□□ -0.82
RPL35BP0CX85 FRD1YEL047C 1413 nt9.96□□□□□ -0.82
RPL35BP0CX85 YNL195CYNL195C 786 nt9.95□□□□□ -0.82
RPL35BP0CX85 UME6YDR207C 2511 nt9.95□□□□□ -0.82
RPL35BP0CX85 RPM1RPM1 483 nt9.94□□□□□ -0.82
RPL35BP0CX85 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.92□□□□□ -0.82
RPL35BP0CX85 YEL076CYEL076C 651 nt9.92□□□□□ -0.82
RPL35BP0CX85 YLR464WYLR464W 651 nt9.92□□□□□ -0.82
RPL35BP0CX85 FMT1YBL013W 1206 nt9.92□□□□□ -0.82
RPL35BP0CX85 RTG1YOL067C 534 nt9.91□□□□□ -0.82
RPL35BP0CX85 YLR235CYLR235C 399 nt9.87□□□□□ -0.83
RPL35BP0CX85 SEC11YIR022W 504 nt9.86□□□□□ -0.83
RPL35BP0CX85 TAT1YBR069C 1860 nt9.84□□□□□ -0.83
RPL35BP0CX85 CWP1YKL096W 720 nt9.83□□□□□ -0.84
RPL35BP0CX85 PCM1YEL058W 1674 nt9.81□□□□□ -0.84
RPL35BP0CX85 HUA1YGR268C 597 nt9.81□□□□□ -0.84
RPL35BP0CX85 ADH2YMR303C 1047 nt9.8□□□□□ -0.84
RPL35BP0CX85 SNF6YHL025W 999 nt9.79□□□□□ -0.84
RPL35BP0CX85 YKL030WYKL030W 606 nt9.79□□□□□ -0.84
RPL35BP0CX85 YSC84YHR016C 1407 nt9.79□□□□□ -0.84
RPL35BP0CX85 RRT12YCR045C 1476 nt9.76□□□□□ -0.85
RPL35BP0CX85 YHL050CYHL050C 2094 nt9.75□□□□□ -0.85
RPL35BP0CX85 PTH1YHR189W 573 nt9.73□□□□□ -0.85
RPL35BP0CX85 RNQ1YCL028W 1218 nt9.73□□□□□ -0.85
RPL35BP0CX85 YIH1YCR059C 777 nt9.72□□□□□ -0.85
RPL35BP0CX85 DIC1YLR348C 897 nt9.69□□□□□ -0.86
RPL35BP0CX85 TIM23YNR017W 669 nt9.68□□□□□ -0.86
RPL35BP0CX85 LCB1YMR296C 1677 nt9.67□□□□□ -0.86
RPL35BP0CX85 PCH2YBR186W 1695 nt9.67□□□□□ -0.86
RPL35BP0CX85 SIM1YIL123W 1431 nt9.63□□□□□ -0.87
RPL35BP0CX85 AQY1YPR192W 918 nt9.62□□□□□ -0.87
RPL35BP0CX85 GUT2YIL155C 1950 nt9.61□□□□□ -0.87
RPL35BP0CX85 YLR179CYLR179C 606 nt9.6□□□□□ -0.87
RPL35BP0CX85 BIO4YNR057C 714 nt9.6□□□□□ -0.87
RPL35BP0CX85 YPR064WYPR064W 420 nt9.6□□□□□ -0.87
RPL35BP0CX85 YLL053CYLL053C 459 nt9.57□□□□□ -0.88
RPL35BP0CX85 YDR094WYDR094W 336 nt9.56□□□□□ -0.88
RPL35BP0CX85 FTR1YER145C 1215 nt9.56□□□□□ -0.88
RPL35BP0CX85 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.56□□□□□ -0.88
RPL35BP0CX85 AHT1YHR093W 549 nt9.55□□□□□ -0.88
RPL35BP0CX85 ERF2YLR246W 1080 nt9.54□□□□□ -0.88
RPL35BP0CX85 BOP3YNL042W 1191 nt9.54□□□□□ -0.88
RPL35BP0CX85 TAD3YLR316C 969 nt9.53□□□□□ -0.88
RPL35BP0CX85 NCP1YHR042W 2076 nt9.52□□□□□ -0.89
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