Protein–RNA interactions for Protein: P0CX84

RPL35A, 60S ribosomal protein L35-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL35AP0CX84 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.71□□□□□ -0.7
RPL35AP0CX84 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.71□□□□□ -0.7
RPL35AP0CX84 SIS1YNL007C 1059 nt10.68□□□□□ -0.7
RPL35AP0CX84 MEP2YNL142W 1500 nt10.66□□□□□ -0.7
RPL35AP0CX84 PUS2YGL063W 1113 nt10.65□□□□□ -0.7
RPL35AP0CX84 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.65□□□□□ -0.7
RPL35AP0CX84 Q0182Q0182 405 nt10.64□□□□□ -0.71
RPL35AP0CX84 PAC11YDR488C 1602 nt10.64□□□□□ -0.71
RPL35AP0CX84 YJL225CYJL225C 5277 nt10.64□□□□□ -0.71
RPL35AP0CX84 IMP2'YIL154C 1041 nt10.63□□□□□ -0.71
RPL35AP0CX84 RPP2AYOL039W 321 nt10.62□□□□□ -0.71
RPL35AP0CX84 YCH1YGR203W 447 nt10.55□□□□□ -0.72
RPL35AP0CX84 DSK2YMR276W 1122 nt10.51□□□□□ -0.73
RPL35AP0CX84 PTP1YDL230W 1008 nt10.5□□□□□ -0.73
RPL35AP0CX84 YJL152WYJL152W 360 nt10.48□□□□□ -0.73
RPL35AP0CX84 PET9YBL030C 957 nt10.47□□□□□ -0.73
RPL35AP0CX84 TIR4YOR009W 1464 nt10.42□□□□□ -0.74
RPL35AP0CX84 IDH1YNL037C 1083 nt10.41□□□□□ -0.74
RPL35AP0CX84 ART5YGR068C 1761 nt10.41□□□□□ -0.74
RPL35AP0CX84 DCW1YKL046C 1350 nt10.39□□□□□ -0.75
RPL35AP0CX84 YMR090WYMR090W 684 nt10.39□□□□□ -0.75
RPL35AP0CX84 CAC2YML102W 1407 nt10.37□□□□□ -0.75
RPL35AP0CX84 GFD2YCL036W 1701 nt10.37□□□□□ -0.75
RPL35AP0CX84 FMP45YDL222C 930 nt10.36□□□□□ -0.75
RPL35AP0CX84 EMI2YDR516C 1503 nt10.36□□□□□ -0.75
RPL35AP0CX84 YLR236CYLR236C 324 nt10.35□□□□□ -0.75
RPL35AP0CX84 YPR011CYPR011C 981 nt10.34□□□□□ -0.75
RPL35AP0CX84 MOT3YMR070W 1473 nt10.34□□□□□ -0.75
RPL35AP0CX84 YMR057CYMR057C 372 nt10.31□□□□□ -0.76
RPL35AP0CX84 YDL221WYDL221W 552 nt10.3□□□□□ -0.76
RPL35AP0CX84 ERV46YAL042W 1248 nt10.3□□□□□ -0.76
RPL35AP0CX84 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.3□□□□□ -0.76
RPL35AP0CX84 SSA4YER103W 1929 nt10.29□□□□□ -0.76
RPL35AP0CX84 GBP2YCL011C 1284 nt10.26□□□□□ -0.77
RPL35AP0CX84 IRC15YPL017C 1500 nt10.22□□□□□ -0.77
RPL35AP0CX84 YDR433WYDR433W 441 nt10.21□□□□□ -0.77
RPL35AP0CX84 YKR040CYKR040C 504 nt10.21□□□□□ -0.77
RPL35AP0CX84 CUE1YMR264W 612 nt10.2□□□□□ -0.78
RPL35AP0CX84 LPX1YOR084W 1164 nt10.19□□□□□ -0.78
RPL35AP0CX84 TCD2YKL027W 1344 nt10.18□□□□□ -0.78
RPL35AP0CX84 SDH1YKL148C 1923 nt10.15□□□□□ -0.78
RPL35AP0CX84 RTS2YOR077W 699 nt10.15□□□□□ -0.78
RPL35AP0CX84 GIS3YLR094C 1509 nt10.14□□□□□ -0.79
RPL35AP0CX84 SCC4YER147C 1875 nt10.11□□□□□ -0.79
RPL35AP0CX84 YBR220CYBR220C 1683 nt10.11□□□□□ -0.79
RPL35AP0CX84 MRPL8YJL063C 717 nt10.1□□□□□ -0.79
RPL35AP0CX84 YIL100WYIL100W 354 nt10.09□□□□□ -0.79
RPL35AP0CX84 RRD1YIL153W 1182 nt10.06□□□□□ -0.8
RPL35AP0CX84 FMP52YER004W 696 nt10.05□□□□□ -0.8
RPL35AP0CX84 MXR2YCL033C 507 nt10.05□□□□□ -0.8
RPL35AP0CX84 DED1YOR204W 1815 nt10.03□□□□□ -0.8
RPL35AP0CX84 ADO1YJR105W 1023 nt9.99□□□□□ -0.81
RPL35AP0CX84 SOR2YDL246C 1074 nt9.98□□□□□ -0.81
RPL35AP0CX84 SOR1YJR159W 1074 nt9.98□□□□□ -0.81
RPL35AP0CX84 YCL042WYCL042W 360 nt9.98□□□□□ -0.81
RPL35AP0CX84 BDF1YLR399C 2061 nt9.98□□□□□ -0.81
RPL35AP0CX84 SPP1YPL138C 1062 nt9.96□□□□□ -0.82
RPL35AP0CX84 FRD1YEL047C 1413 nt9.96□□□□□ -0.82
RPL35AP0CX84 YNL195CYNL195C 786 nt9.95□□□□□ -0.82
RPL35AP0CX84 UME6YDR207C 2511 nt9.95□□□□□ -0.82
RPL35AP0CX84 RPM1RPM1 483 nt9.94□□□□□ -0.82
RPL35AP0CX84 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.92□□□□□ -0.82
RPL35AP0CX84 YEL076CYEL076C 651 nt9.92□□□□□ -0.82
RPL35AP0CX84 YLR464WYLR464W 651 nt9.92□□□□□ -0.82
RPL35AP0CX84 FMT1YBL013W 1206 nt9.92□□□□□ -0.82
RPL35AP0CX84 RTG1YOL067C 534 nt9.91□□□□□ -0.82
RPL35AP0CX84 YLR235CYLR235C 399 nt9.87□□□□□ -0.83
RPL35AP0CX84 SEC11YIR022W 504 nt9.86□□□□□ -0.83
RPL35AP0CX84 TAT1YBR069C 1860 nt9.84□□□□□ -0.83
RPL35AP0CX84 CWP1YKL096W 720 nt9.83□□□□□ -0.84
RPL35AP0CX84 PCM1YEL058W 1674 nt9.81□□□□□ -0.84
RPL35AP0CX84 HUA1YGR268C 597 nt9.81□□□□□ -0.84
RPL35AP0CX84 ADH2YMR303C 1047 nt9.8□□□□□ -0.84
RPL35AP0CX84 SNF6YHL025W 999 nt9.79□□□□□ -0.84
RPL35AP0CX84 YKL030WYKL030W 606 nt9.79□□□□□ -0.84
RPL35AP0CX84 YSC84YHR016C 1407 nt9.79□□□□□ -0.84
RPL35AP0CX84 RRT12YCR045C 1476 nt9.76□□□□□ -0.85
RPL35AP0CX84 YHL050CYHL050C 2094 nt9.75□□□□□ -0.85
RPL35AP0CX84 PTH1YHR189W 573 nt9.73□□□□□ -0.85
RPL35AP0CX84 RNQ1YCL028W 1218 nt9.73□□□□□ -0.85
RPL35AP0CX84 YIH1YCR059C 777 nt9.72□□□□□ -0.85
RPL35AP0CX84 DIC1YLR348C 897 nt9.69□□□□□ -0.86
RPL35AP0CX84 TIM23YNR017W 669 nt9.68□□□□□ -0.86
RPL35AP0CX84 LCB1YMR296C 1677 nt9.67□□□□□ -0.86
RPL35AP0CX84 PCH2YBR186W 1695 nt9.67□□□□□ -0.86
RPL35AP0CX84 SIM1YIL123W 1431 nt9.63□□□□□ -0.87
RPL35AP0CX84 AQY1YPR192W 918 nt9.62□□□□□ -0.87
RPL35AP0CX84 GUT2YIL155C 1950 nt9.61□□□□□ -0.87
RPL35AP0CX84 YLR179CYLR179C 606 nt9.6□□□□□ -0.87
RPL35AP0CX84 BIO4YNR057C 714 nt9.6□□□□□ -0.87
RPL35AP0CX84 YPR064WYPR064W 420 nt9.6□□□□□ -0.87
RPL35AP0CX84 YLL053CYLL053C 459 nt9.57□□□□□ -0.88
RPL35AP0CX84 YDR094WYDR094W 336 nt9.56□□□□□ -0.88
RPL35AP0CX84 FTR1YER145C 1215 nt9.56□□□□□ -0.88
RPL35AP0CX84 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.56□□□□□ -0.88
RPL35AP0CX84 AHT1YHR093W 549 nt9.55□□□□□ -0.88
RPL35AP0CX84 ERF2YLR246W 1080 nt9.54□□□□□ -0.88
RPL35AP0CX84 BOP3YNL042W 1191 nt9.54□□□□□ -0.88
RPL35AP0CX84 TAD3YLR316C 969 nt9.53□□□□□ -0.88
RPL35AP0CX84 NCP1YHR042W 2076 nt9.52□□□□□ -0.89
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