Protein–RNA interactions for Protein: P0CX24

RPL20B, 60S ribosomal protein L20-B, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL20BP0CX24 PUS2YGL063W 1113 nt11.3□□□□□ -0.6
RPL20BP0CX24 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.3□□□□□ -0.6
RPL20BP0CX24 RPP2AYOL039W 321 nt11.3□□□□□ -0.6
RPL20BP0CX24 DCW1YKL046C 1350 nt11.29□□□□□ -0.6
RPL20BP0CX24 SSA4YER103W 1929 nt11.27□□□□□ -0.6
RPL20BP0CX24 PTP1YDL230W 1008 nt11.25□□□□□ -0.61
RPL20BP0CX24 YJL152WYJL152W 360 nt11.19□□□□□ -0.62
RPL20BP0CX24 TIR4YOR009W 1464 nt11.17□□□□□ -0.62
RPL20BP0CX24 ART5YGR068C 1761 nt11.16□□□□□ -0.62
RPL20BP0CX24 CAC2YML102W 1407 nt11.16□□□□□ -0.62
RPL20BP0CX24 EMI2YDR516C 1503 nt11.14□□□□□ -0.63
RPL20BP0CX24 YCH1YGR203W 447 nt11.13□□□□□ -0.63
RPL20BP0CX24 DSK2YMR276W 1122 nt11.13□□□□□ -0.63
RPL20BP0CX24 IMP2'YIL154C 1041 nt11.11□□□□□ -0.63
RPL20BP0CX24 GFD2YCL036W 1701 nt11.1□□□□□ -0.63
RPL20BP0CX24 PET9YBL030C 957 nt11.1□□□□□ -0.63
RPL20BP0CX24 YPR011CYPR011C 981 nt11.09□□□□□ -0.63
RPL20BP0CX24 YLR236CYLR236C 324 nt11.08□□□□□ -0.64
RPL20BP0CX24 YDL221WYDL221W 552 nt11.07□□□□□ -0.64
RPL20BP0CX24 YMR057CYMR057C 372 nt11.04□□□□□ -0.64
RPL20BP0CX24 YMR090WYMR090W 684 nt11.02□□□□□ -0.65
RPL20BP0CX24 FMP45YDL222C 930 nt11.01□□□□□ -0.65
RPL20BP0CX24 IDH1YNL037C 1083 nt11.01□□□□□ -0.65
RPL20BP0CX24 IRC15YPL017C 1500 nt11□□□□□ -0.65
RPL20BP0CX24 YBR220CYBR220C 1683 nt10.95□□□□□ -0.66
RPL20BP0CX24 RTS2YOR077W 699 nt10.95□□□□□ -0.66
RPL20BP0CX24 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.94□□□□□ -0.66
RPL20BP0CX24 MOT3YMR070W 1473 nt10.93□□□□□ -0.66
RPL20BP0CX24 SDH1YKL148C 1923 nt10.92□□□□□ -0.66
RPL20BP0CX24 GBP2YCL011C 1284 nt10.92□□□□□ -0.66
RPL20BP0CX24 GIS3YLR094C 1509 nt10.91□□□□□ -0.66
RPL20BP0CX24 FPS1YLL043W 2010 nt10.9□□□□□ -0.66
RPL20BP0CX24 ERV46YAL042W 1248 nt10.89□□□□□ -0.67
RPL20BP0CX24 LPX1YOR084W 1164 nt10.89□□□□□ -0.67
RPL20BP0CX24 YDR433WYDR433W 441 nt10.88□□□□□ -0.67
RPL20BP0CX24 CUE1YMR264W 612 nt10.86□□□□□ -0.67
RPL20BP0CX24 SCC4YER147C 1875 nt10.85□□□□□ -0.67
RPL20BP0CX24 BDF1YLR399C 2061 nt10.84□□□□□ -0.67
RPL20BP0CX24 YKR040CYKR040C 504 nt10.8□□□□□ -0.68
RPL20BP0CX24 MXR2YCL033C 507 nt10.8□□□□□ -0.68
RPL20BP0CX24 TCD2YKL027W 1344 nt10.79□□□□□ -0.68
RPL20BP0CX24 RRD1YIL153W 1182 nt10.75□□□□□ -0.69
RPL20BP0CX24 DED1YOR204W 1815 nt10.74□□□□□ -0.69
RPL20BP0CX24 YIL100WYIL100W 354 nt10.73□□□□□ -0.69
RPL20BP0CX24 SPP1YPL138C 1062 nt10.71□□□□□ -0.69
RPL20BP0CX24 TAT1YBR069C 1860 nt10.71□□□□□ -0.69
RPL20BP0CX24 FMT1YBL013W 1206 nt10.63□□□□□ -0.71
RPL20BP0CX24 FRD1YEL047C 1413 nt10.61□□□□□ -0.71
RPL20BP0CX24 FMP52YER004W 696 nt10.6□□□□□ -0.71
RPL20BP0CX24 YSC84YHR016C 1407 nt10.59□□□□□ -0.71
RPL20BP0CX24 YCL042WYCL042W 360 nt10.58□□□□□ -0.72
RPL20BP0CX24 SOR2YDL246C 1074 nt10.57□□□□□ -0.72
RPL20BP0CX24 SOR1YJR159W 1074 nt10.57□□□□□ -0.72
RPL20BP0CX24 RRT12YCR045C 1476 nt10.56□□□□□ -0.72
RPL20BP0CX24 YNL195CYNL195C 786 nt10.56□□□□□ -0.72
RPL20BP0CX24 YHL050CYHL050C 2094 nt10.56□□□□□ -0.72
RPL20BP0CX24 SEC11YIR022W 504 nt10.54□□□□□ -0.72
RPL20BP0CX24 MRPL8YJL063C 717 nt10.53□□□□□ -0.72
RPL20BP0CX24 CWP1YKL096W 720 nt10.52□□□□□ -0.73
RPL20BP0CX24 RTG1YOL067C 534 nt10.51□□□□□ -0.73
RPL20BP0CX24 ADH2YMR303C 1047 nt10.5□□□□□ -0.73
RPL20BP0CX24 PCH2YBR186W 1695 nt10.49□□□□□ -0.73
RPL20BP0CX24 PCM1YEL058W 1674 nt10.47□□□□□ -0.73
RPL20BP0CX24 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.46□□□□□ -0.73
RPL20BP0CX24 YEL076CYEL076C 651 nt10.46□□□□□ -0.73
RPL20BP0CX24 YLR464WYLR464W 651 nt10.46□□□□□ -0.73
RPL20BP0CX24 GUT2YIL155C 1950 nt10.44□□□□□ -0.74
RPL20BP0CX24 PTH1YHR189W 573 nt10.43□□□□□ -0.74
RPL20BP0CX24 ADO1YJR105W 1023 nt10.43□□□□□ -0.74
RPL20BP0CX24 SNF6YHL025W 999 nt10.42□□□□□ -0.74
RPL20BP0CX24 Q0182Q0182 405 nt10.41□□□□□ -0.74
RPL20BP0CX24 YLR235CYLR235C 399 nt10.4□□□□□ -0.74
RPL20BP0CX24 YKL030WYKL030W 606 nt10.35□□□□□ -0.75
RPL20BP0CX24 YIH1YCR059C 777 nt10.32□□□□□ -0.76
RPL20BP0CX24 HUA1YGR268C 597 nt10.32□□□□□ -0.76
RPL20BP0CX24 DIC1YLR348C 897 nt10.32□□□□□ -0.76
RPL20BP0CX24 RNQ1YCL028W 1218 nt10.32□□□□□ -0.76
RPL20BP0CX24 PIB2YGL023C 1908 nt10.31□□□□□ -0.76
RPL20BP0CX24 LCB1YMR296C 1677 nt10.31□□□□□ -0.76
RPL20BP0CX24 SIM1YIL123W 1431 nt10.29□□□□□ -0.76
RPL20BP0CX24 BIO4YNR057C 714 nt10.27□□□□□ -0.77
RPL20BP0CX24 RTF1YGL244W 1677 nt10.27□□□□□ -0.77
RPL20BP0CX24 TIM23YNR017W 669 nt10.26□□□□□ -0.77
RPL20BP0CX24 NCP1YHR042W 2076 nt10.26□□□□□ -0.77
RPL20BP0CX24 BOP3YNL042W 1191 nt10.24□□□□□ -0.77
RPL20BP0CX24 YLL053CYLL053C 459 nt10.23□□□□□ -0.77
RPL20BP0CX24 YLR179CYLR179C 606 nt10.21□□□□□ -0.77
RPL20BP0CX24 FTR1YER145C 1215 nt10.16□□□□□ -0.78
RPL20BP0CX24 GAL1YBR020W 1587 nt10.14□□□□□ -0.79
RPL20BP0CX24 YPR064WYPR064W 420 nt10.13□□□□□ -0.79
RPL20BP0CX24 WSC2YNL283C 1512 nt10.12□□□□□ -0.79
RPL20BP0CX24 PTK1YKL198C 1989 nt10.12□□□□□ -0.79
RPL20BP0CX24 AHT1YHR093W 549 nt10.12□□□□□ -0.79
RPL20BP0CX24 ERF2YLR246W 1080 nt10.11□□□□□ -0.79
RPL20BP0CX24 AQY1YPR192W 918 nt10.11□□□□□ -0.79
RPL20BP0CX24 UBX6YJL048C 1191 nt10.1□□□□□ -0.79
RPL20BP0CX24 TRM5YHR070W 1500 nt10.1□□□□□ -0.79
RPL20BP0CX24 ATF2YGR177C 1608 nt10.08□□□□□ -0.8
RPL20BP0CX24 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.08□□□□□ -0.8
RPL20BP0CX24 TAD3YLR316C 969 nt10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.1 ms