Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd3P09027 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd3P09027 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd3P09027 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd3P09027 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd3P09027 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd3P09027 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd3P09027 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd3P09027 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd3P09027 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd3P09027 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd3P09027 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd3P09027 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd3P09027 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd3P09027 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd3P09027 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd3P09027 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd3P09027 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd3P09027 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd3P09027 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd3P09027 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd3P09027 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd3P09027 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd3P09027 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd3P09027 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd3P09027 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd3P09027 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd3P09027 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd3P09027 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd3P09027 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd3P09027 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd3P09027 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd3P09027 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd3P09027 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd3P09027 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd3P09027 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd3P09027 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxd3P09027 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd3P09027 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd3P09027 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd3P09027 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd3P09027 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd3P09027 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd3P09027 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd3P09027 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd3P09027 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd3P09027 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd3P09027 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxd3P09027 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd3P09027 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd3P09027 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd3P09027 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd3P09027 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd3P09027 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd3P09027 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd3P09027 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd3P09027 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd3P09027 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd3P09027 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd3P09027 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd3P09027 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxd3P09027 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd3P09027 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd3P09027 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd3P09027 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd3P09027 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd3P09027 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd3P09027 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd3P09027 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd3P09027 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd3P09027 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd3P09027 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd3P09027 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd3P09027 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd3P09027 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd3P09027 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd3P09027 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd3P09027 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd3P09027 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd3P09027 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd3P09027 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd3P09027 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd3P09027 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd3P09027 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd3P09027 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd3P09027 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd3P09027 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd3P09027 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd3P09027 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd3P09027 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd3P09027 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd3P09027 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd3P09027 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd3P09027 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd3P09027 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd3P09027 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd3P09027 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd3P09027 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd3P09027 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd3P09027 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms