Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spta1P08032 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spta1P08032 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spta1P08032 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spta1P08032 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spta1P08032 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Spta1P08032 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Spta1P08032 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Spta1P08032 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Spta1P08032 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Spta1P08032 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spta1P08032 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Spta1P08032 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Spta1P08032 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Spta1P08032 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spta1P08032 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Spta1P08032 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Spta1P08032 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Spta1P08032 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Spta1P08032 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spta1P08032 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Spta1P08032 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spta1P08032 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spta1P08032 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spta1P08032 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spta1P08032 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spta1P08032 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Spta1P08032 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Spta1P08032 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spta1P08032 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spta1P08032 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Spta1P08032 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Spta1P08032 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Spta1P08032 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spta1P08032 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spta1P08032 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spta1P08032 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spta1P08032 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Spta1P08032 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Spta1P08032 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spta1P08032 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Spta1P08032 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Spta1P08032 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spta1P08032 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spta1P08032 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spta1P08032 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Spta1P08032 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spta1P08032 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spta1P08032 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spta1P08032 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spta1P08032 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spta1P08032 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spta1P08032 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spta1P08032 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spta1P08032 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spta1P08032 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spta1P08032 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spta1P08032 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spta1P08032 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spta1P08032 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spta1P08032 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spta1P08032 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spta1P08032 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spta1P08032 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Spta1P08032 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Spta1P08032 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spta1P08032 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spta1P08032 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spta1P08032 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spta1P08032 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spta1P08032 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spta1P08032 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spta1P08032 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Spta1P08032 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spta1P08032 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spta1P08032 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spta1P08032 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spta1P08032 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Spta1P08032 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spta1P08032 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spta1P08032 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spta1P08032 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spta1P08032 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spta1P08032 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spta1P08032 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Spta1P08032 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spta1P08032 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spta1P08032 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spta1P08032 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spta1P08032 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spta1P08032 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spta1P08032 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spta1P08032 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spta1P08032 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spta1P08032 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spta1P08032 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spta1P08032 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spta1P08032 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spta1P08032 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spta1P08032 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms