Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C9P06683 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C9P06683 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9P06683 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9P06683 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9P06683 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9P06683 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9P06683 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9P06683 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9P06683 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9P06683 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9P06683 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9P06683 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9P06683 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C9P06683 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9P06683 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9P06683 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9P06683 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9P06683 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9P06683 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9P06683 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
C9P06683 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9P06683 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
C9P06683 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9P06683 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9P06683 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9P06683 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9P06683 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9P06683 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9P06683 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9P06683 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9P06683 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9P06683 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9P06683 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9P06683 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9P06683 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9P06683 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9P06683 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C9P06683 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C9P06683 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C9P06683 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9P06683 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9P06683 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9P06683 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9P06683 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9P06683 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9P06683 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9P06683 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C9P06683 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C9P06683 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9P06683 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C9P06683 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9P06683 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9P06683 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9P06683 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9P06683 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9P06683 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9P06683 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C9P06683 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9P06683 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9P06683 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9P06683 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9P06683 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9P06683 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9P06683 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9P06683 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9P06683 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9P06683 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9P06683 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9P06683 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9P06683 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9P06683 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9P06683 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9P06683 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9P06683 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9P06683 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C9P06683 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9P06683 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9P06683 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C9P06683 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9P06683 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9P06683 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9P06683 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9P06683 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9P06683 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C9P06683 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9P06683 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C9P06683 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9P06683 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9P06683 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C9P06683 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9P06683 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9P06683 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9P06683 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9P06683 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9P06683 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9P06683 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9P06683 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9P06683 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9P06683 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms