Protein–RNA interactions for Protein: O89053

Coro1a, Coronin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coro1aO89053 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Coro1aO89053 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Coro1aO89053 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Coro1aO89053 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Coro1aO89053 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Coro1aO89053 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Coro1aO89053 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Coro1aO89053 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Coro1aO89053 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Coro1aO89053 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Coro1aO89053 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Coro1aO89053 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Coro1aO89053 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Coro1aO89053 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Coro1aO89053 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Coro1aO89053 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Coro1aO89053 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Coro1aO89053 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Coro1aO89053 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Coro1aO89053 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Coro1aO89053 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Coro1aO89053 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Coro1aO89053 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Coro1aO89053 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Coro1aO89053 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Coro1aO89053 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Coro1aO89053 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Coro1aO89053 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Coro1aO89053 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Coro1aO89053 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Coro1aO89053 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Coro1aO89053 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Coro1aO89053 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Coro1aO89053 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Coro1aO89053 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Coro1aO89053 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Coro1aO89053 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Coro1aO89053 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Coro1aO89053 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Coro1aO89053 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Coro1aO89053 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Coro1aO89053 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Coro1aO89053 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Coro1aO89053 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Coro1aO89053 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Coro1aO89053 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Coro1aO89053 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Coro1aO89053 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Coro1aO89053 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Coro1aO89053 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Coro1aO89053 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Coro1aO89053 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Coro1aO89053 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Coro1aO89053 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Coro1aO89053 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Coro1aO89053 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Coro1aO89053 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Coro1aO89053 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Coro1aO89053 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Coro1aO89053 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Coro1aO89053 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Coro1aO89053 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Coro1aO89053 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Coro1aO89053 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Coro1aO89053 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Coro1aO89053 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Coro1aO89053 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Coro1aO89053 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Coro1aO89053 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Coro1aO89053 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Coro1aO89053 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Coro1aO89053 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Coro1aO89053 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Coro1aO89053 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Coro1aO89053 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Coro1aO89053 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Coro1aO89053 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Coro1aO89053 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Coro1aO89053 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Coro1aO89053 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Coro1aO89053 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Coro1aO89053 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Coro1aO89053 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Coro1aO89053 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Coro1aO89053 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Coro1aO89053 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Coro1aO89053 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Coro1aO89053 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Coro1aO89053 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Coro1aO89053 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Coro1aO89053 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Coro1aO89053 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Coro1aO89053 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Coro1aO89053 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Coro1aO89053 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Coro1aO89053 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Coro1aO89053 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Coro1aO89053 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Coro1aO89053 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Coro1aO89053 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms