Protein–RNA interactions for Protein: O89053

Coro1a, Coronin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coro1aO89053 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
Coro1aO89053 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Coro1aO89053 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Coro1aO89053 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Coro1aO89053 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Coro1aO89053 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Coro1aO89053 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Coro1aO89053 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Coro1aO89053 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Coro1aO89053 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Coro1aO89053 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Coro1aO89053 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Coro1aO89053 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Coro1aO89053 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Coro1aO89053 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Coro1aO89053 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Coro1aO89053 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Coro1aO89053 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Coro1aO89053 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Coro1aO89053 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Coro1aO89053 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Coro1aO89053 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Coro1aO89053 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Coro1aO89053 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Coro1aO89053 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Coro1aO89053 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Coro1aO89053 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Coro1aO89053 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Coro1aO89053 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Coro1aO89053 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Coro1aO89053 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Coro1aO89053 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Coro1aO89053 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Coro1aO89053 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Coro1aO89053 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Coro1aO89053 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Coro1aO89053 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Coro1aO89053 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Coro1aO89053 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Coro1aO89053 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Coro1aO89053 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Coro1aO89053 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Coro1aO89053 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Coro1aO89053 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Coro1aO89053 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Coro1aO89053 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Coro1aO89053 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Coro1aO89053 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Coro1aO89053 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Coro1aO89053 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Coro1aO89053 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Coro1aO89053 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Coro1aO89053 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Coro1aO89053 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Coro1aO89053 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Coro1aO89053 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Coro1aO89053 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Coro1aO89053 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Coro1aO89053 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Coro1aO89053 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Coro1aO89053 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Coro1aO89053 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Coro1aO89053 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Coro1aO89053 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Coro1aO89053 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Coro1aO89053 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Coro1aO89053 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Coro1aO89053 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Coro1aO89053 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Coro1aO89053 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Coro1aO89053 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Coro1aO89053 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Coro1aO89053 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Coro1aO89053 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Coro1aO89053 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Coro1aO89053 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Coro1aO89053 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Coro1aO89053 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Coro1aO89053 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Coro1aO89053 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Coro1aO89053 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Coro1aO89053 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Coro1aO89053 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Coro1aO89053 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Coro1aO89053 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Coro1aO89053 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Coro1aO89053 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Coro1aO89053 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Coro1aO89053 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Coro1aO89053 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Coro1aO89053 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Coro1aO89053 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Coro1aO89053 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Coro1aO89053 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Coro1aO89053 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Coro1aO89053 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Coro1aO89053 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Coro1aO89053 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Coro1aO89053 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Coro1aO89053 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms