Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Nid2O88322 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Nid2O88322 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Nid2O88322 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Nid2O88322 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Nid2O88322 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Nid2O88322 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Nid2O88322 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Nid2O88322 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Nid2O88322 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Nid2O88322 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Nid2O88322 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Nid2O88322 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Nid2O88322 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Nid2O88322 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Nid2O88322 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Nid2O88322 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Nid2O88322 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Nid2O88322 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Nid2O88322 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Nid2O88322 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Nid2O88322 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Nid2O88322 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Nid2O88322 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Nid2O88322 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Nid2O88322 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Nid2O88322 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Nid2O88322 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Nid2O88322 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Nid2O88322 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Nid2O88322 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Nid2O88322 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Nid2O88322 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Nid2O88322 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Nid2O88322 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Nid2O88322 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Nid2O88322 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Nid2O88322 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Nid2O88322 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Nid2O88322 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Nid2O88322 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Nid2O88322 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Nid2O88322 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Nid2O88322 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Nid2O88322 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Nid2O88322 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Nid2O88322 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Nid2O88322 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Nid2O88322 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Nid2O88322 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Nid2O88322 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Nid2O88322 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Nid2O88322 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Nid2O88322 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Nid2O88322 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
Nid2O88322 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Nid2O88322 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Nid2O88322 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Nid2O88322 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Nid2O88322 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Nid2O88322 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Nid2O88322 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Nid2O88322 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Nid2O88322 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Nid2O88322 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Nid2O88322 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Nid2O88322 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Nid2O88322 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Nid2O88322 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Nid2O88322 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Nid2O88322 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Nid2O88322 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Nid2O88322 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Nid2O88322 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Nid2O88322 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Nid2O88322 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Nid2O88322 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Nid2O88322 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Nid2O88322 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Nid2O88322 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Nid2O88322 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Nid2O88322 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Nid2O88322 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Nid2O88322 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Nid2O88322 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Nid2O88322 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Nid2O88322 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Nid2O88322 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Nid2O88322 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Nid2O88322 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Nid2O88322 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Nid2O88322 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Nid2O88322 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Nid2O88322 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Nid2O88322 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Nid2O88322 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Nid2O88322 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Nid2O88322 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Nid2O88322 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Nid2O88322 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145 ms