Protein–RNA interactions for Protein: O55192

Slc6a2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a2O55192 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc6a2O55192 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc6a2O55192 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc6a2O55192 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc6a2O55192 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc6a2O55192 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc6a2O55192 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc6a2O55192 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc6a2O55192 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc6a2O55192 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc6a2O55192 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc6a2O55192 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc6a2O55192 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc6a2O55192 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Slc6a2O55192 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc6a2O55192 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc6a2O55192 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc6a2O55192 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc6a2O55192 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc6a2O55192 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc6a2O55192 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc6a2O55192 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slc6a2O55192 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slc6a2O55192 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc6a2O55192 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc6a2O55192 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc6a2O55192 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc6a2O55192 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc6a2O55192 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc6a2O55192 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Slc6a2O55192 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc6a2O55192 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc6a2O55192 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc6a2O55192 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc6a2O55192 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc6a2O55192 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc6a2O55192 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc6a2O55192 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc6a2O55192 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc6a2O55192 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc6a2O55192 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc6a2O55192 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc6a2O55192 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc6a2O55192 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc6a2O55192 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc6a2O55192 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc6a2O55192 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc6a2O55192 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc6a2O55192 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc6a2O55192 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc6a2O55192 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc6a2O55192 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc6a2O55192 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc6a2O55192 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc6a2O55192 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc6a2O55192 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc6a2O55192 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc6a2O55192 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Slc6a2O55192 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc6a2O55192 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc6a2O55192 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc6a2O55192 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc6a2O55192 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc6a2O55192 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc6a2O55192 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc6a2O55192 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc6a2O55192 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc6a2O55192 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc6a2O55192 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc6a2O55192 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc6a2O55192 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc6a2O55192 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc6a2O55192 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slc6a2O55192 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc6a2O55192 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc6a2O55192 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc6a2O55192 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc6a2O55192 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc6a2O55192 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc6a2O55192 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc6a2O55192 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc6a2O55192 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc6a2O55192 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc6a2O55192 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc6a2O55192 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc6a2O55192 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc6a2O55192 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc6a2O55192 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc6a2O55192 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc6a2O55192 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc6a2O55192 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc6a2O55192 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc6a2O55192 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc6a2O55192 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc6a2O55192 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc6a2O55192 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc6a2O55192 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc6a2O55192 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc6a2O55192 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc6a2O55192 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms