Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Pkd2O35245 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Pkd2O35245 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
Pkd2O35245 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Pkd2O35245 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Pkd2O35245 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Pkd2O35245 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Pkd2O35245 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Pkd2O35245 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
Pkd2O35245 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
Pkd2O35245 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Pkd2O35245 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Pkd2O35245 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Pkd2O35245 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Pkd2O35245 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Pkd2O35245 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Pkd2O35245 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Pkd2O35245 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Pkd2O35245 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
Pkd2O35245 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Pkd2O35245 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Pkd2O35245 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Pkd2O35245 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Pkd2O35245 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Pkd2O35245 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Pkd2O35245 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Pkd2O35245 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Pkd2O35245 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Pkd2O35245 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Pkd2O35245 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
Pkd2O35245 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Pkd2O35245 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Pkd2O35245 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Pkd2O35245 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Pkd2O35245 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Pkd2O35245 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Pkd2O35245 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Pkd2O35245 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Pkd2O35245 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Pkd2O35245 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Pkd2O35245 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Pkd2O35245 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Pkd2O35245 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
Pkd2O35245 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Pkd2O35245 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
Pkd2O35245 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Pkd2O35245 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Pkd2O35245 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Pkd2O35245 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Pkd2O35245 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Pkd2O35245 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
Pkd2O35245 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Pkd2O35245 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Pkd2O35245 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
Pkd2O35245 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Pkd2O35245 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Pkd2O35245 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Pkd2O35245 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Pkd2O35245 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
Pkd2O35245 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Pkd2O35245 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
Pkd2O35245 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Pkd2O35245 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Pkd2O35245 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Pkd2O35245 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Pkd2O35245 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Pkd2O35245 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Pkd2O35245 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Pkd2O35245 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Pkd2O35245 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Pkd2O35245 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Pkd2O35245 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Pkd2O35245 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Pkd2O35245 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Pkd2O35245 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Pkd2O35245 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Pkd2O35245 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Pkd2O35245 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Pkd2O35245 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Pkd2O35245 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
Pkd2O35245 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Pkd2O35245 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Pkd2O35245 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Pkd2O35245 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Pkd2O35245 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Pkd2O35245 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Pkd2O35245 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Pkd2O35245 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Pkd2O35245 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Pkd2O35245 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Pkd2O35245 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Pkd2O35245 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Pkd2O35245 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Pkd2O35245 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Pkd2O35245 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Pkd2O35245 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Pkd2O35245 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Pkd2O35245 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Pkd2O35245 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Pkd2O35245 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms