Protein–RNA interactions for Protein: L7N213

Vmn1r86, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r86L7N213 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vmn1r86L7N213 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vmn1r86L7N213 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vmn1r86L7N213 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Vmn1r86L7N213 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vmn1r86L7N213 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vmn1r86L7N213 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vmn1r86L7N213 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vmn1r86L7N213 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vmn1r86L7N213 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vmn1r86L7N213 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vmn1r86L7N213 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vmn1r86L7N213 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vmn1r86L7N213 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vmn1r86L7N213 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vmn1r86L7N213 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vmn1r86L7N213 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vmn1r86L7N213 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vmn1r86L7N213 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Vmn1r86L7N213 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vmn1r86L7N213 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vmn1r86L7N213 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vmn1r86L7N213 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Vmn1r86L7N213 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vmn1r86L7N213 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vmn1r86L7N213 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vmn1r86L7N213 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vmn1r86L7N213 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Vmn1r86L7N213 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vmn1r86L7N213 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vmn1r86L7N213 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vmn1r86L7N213 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Vmn1r86L7N213 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vmn1r86L7N213 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vmn1r86L7N213 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vmn1r86L7N213 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vmn1r86L7N213 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vmn1r86L7N213 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vmn1r86L7N213 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vmn1r86L7N213 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vmn1r86L7N213 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vmn1r86L7N213 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Vmn1r86L7N213 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vmn1r86L7N213 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vmn1r86L7N213 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vmn1r86L7N213 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vmn1r86L7N213 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vmn1r86L7N213 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vmn1r86L7N213 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vmn1r86L7N213 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Vmn1r86L7N213 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vmn1r86L7N213 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vmn1r86L7N213 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vmn1r86L7N213 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Vmn1r86L7N213 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Vmn1r86L7N213 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vmn1r86L7N213 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Vmn1r86L7N213 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vmn1r86L7N213 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vmn1r86L7N213 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Vmn1r86L7N213 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vmn1r86L7N213 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vmn1r86L7N213 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vmn1r86L7N213 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vmn1r86L7N213 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vmn1r86L7N213 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vmn1r86L7N213 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vmn1r86L7N213 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vmn1r86L7N213 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vmn1r86L7N213 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vmn1r86L7N213 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vmn1r86L7N213 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vmn1r86L7N213 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vmn1r86L7N213 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Vmn1r86L7N213 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vmn1r86L7N213 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vmn1r86L7N213 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vmn1r86L7N213 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vmn1r86L7N213 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vmn1r86L7N213 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vmn1r86L7N213 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vmn1r86L7N213 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vmn1r86L7N213 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vmn1r86L7N213 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vmn1r86L7N213 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vmn1r86L7N213 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vmn1r86L7N213 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vmn1r86L7N213 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vmn1r86L7N213 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vmn1r86L7N213 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Vmn1r86L7N213 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Vmn1r86L7N213 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vmn1r86L7N213 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vmn1r86L7N213 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vmn1r86L7N213 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vmn1r86L7N213 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vmn1r86L7N213 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vmn1r86L7N213 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vmn1r86L7N213 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vmn1r86L7N213 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms