Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn1r80L7N1Z3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn1r80L7N1Z3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r80L7N1Z3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn1r80L7N1Z3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vmn1r80L7N1Z3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn1r80L7N1Z3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn1r80L7N1Z3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r80L7N1Z3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r80L7N1Z3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r80L7N1Z3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r80L7N1Z3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r80L7N1Z3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r80L7N1Z3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r80L7N1Z3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r80L7N1Z3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r80L7N1Z3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r80L7N1Z3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r80L7N1Z3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r80L7N1Z3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r80L7N1Z3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r80L7N1Z3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r80L7N1Z3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r80L7N1Z3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r80L7N1Z3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r80L7N1Z3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r80L7N1Z3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r80L7N1Z3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r80L7N1Z3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn1r80L7N1Z3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r80L7N1Z3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r80L7N1Z3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r80L7N1Z3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmn1r80L7N1Z3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r80L7N1Z3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn1r80L7N1Z3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn1r80L7N1Z3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn1r80L7N1Z3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r80L7N1Z3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn1r80L7N1Z3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r80L7N1Z3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn1r80L7N1Z3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn1r80L7N1Z3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r80L7N1Z3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r80L7N1Z3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r80L7N1Z3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r80L7N1Z3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r80L7N1Z3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r80L7N1Z3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r80L7N1Z3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r80L7N1Z3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r80L7N1Z3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r80L7N1Z3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r80L7N1Z3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r80L7N1Z3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r80L7N1Z3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r80L7N1Z3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r80L7N1Z3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r80L7N1Z3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r80L7N1Z3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r80L7N1Z3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r80L7N1Z3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r80L7N1Z3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r80L7N1Z3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r80L7N1Z3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r80L7N1Z3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r80L7N1Z3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r80L7N1Z3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r80L7N1Z3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r80L7N1Z3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r80L7N1Z3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r80L7N1Z3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r80L7N1Z3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r80L7N1Z3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r80L7N1Z3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r80L7N1Z3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r80L7N1Z3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r80L7N1Z3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r80L7N1Z3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r80L7N1Z3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r80L7N1Z3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r80L7N1Z3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r80L7N1Z3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r80L7N1Z3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r80L7N1Z3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r80L7N1Z3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r80L7N1Z3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r80L7N1Z3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r80L7N1Z3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r80L7N1Z3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r80L7N1Z3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r80L7N1Z3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r80L7N1Z3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r80L7N1Z3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r80L7N1Z3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r80L7N1Z3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r80L7N1Z3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms