Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC53.5■■■■■ 6.15
BicraF8VPZ9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC53.49■■■■■ 6.15
BicraF8VPZ9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.49■■■■■ 6.15
BicraF8VPZ9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC53.42■■■■■ 6.14
BicraF8VPZ9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.25■■■■■ 6.12
BicraF8VPZ9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.21■■■■■ 6.11
BicraF8VPZ9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.16■■■■■ 6.1
BicraF8VPZ9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.15■■■■■ 6.1
BicraF8VPZ9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.09■■■■■ 6.09
BicraF8VPZ9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC53.06■■■■■ 6.09
BicraF8VPZ9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC53.01■■■■■ 6.08
BicraF8VPZ9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC52.94■■■■■ 6.07
BicraF8VPZ9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.93■■■■■ 6.06
BicraF8VPZ9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.85■■■■■ 6.05
BicraF8VPZ9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC52.79■■■■■ 6.04
BicraF8VPZ9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC52.73■■■■■ 6.03
BicraF8VPZ9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.71■■■■■ 6.03
BicraF8VPZ9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.71■■■■■ 6.03
BicraF8VPZ9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.66■■■■■ 6.02
BicraF8VPZ9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC52.64■■■■■ 6.02
BicraF8VPZ9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC52.64■■■■■ 6.02
BicraF8VPZ9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC52.6■■■■■ 6.01
BicraF8VPZ9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC52.6■■■■■ 6.01
BicraF8VPZ9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC52.53■■■■■ 6
BicraF8VPZ9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC52.53■■■■■ 6
BicraF8VPZ9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC52.51■■■■■ 6
BicraF8VPZ9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.5■■■■■ 5.99
BicraF8VPZ9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC52.49■■■■■ 5.99
BicraF8VPZ9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
BicraF8VPZ9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
BicraF8VPZ9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC52.3■■■■■ 5.96
BicraF8VPZ9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.25■■■■■ 5.96
BicraF8VPZ9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC52.25■■■■■ 5.96
BicraF8VPZ9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.21■■■■■ 5.95
BicraF8VPZ9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.16■■■■■ 5.94
BicraF8VPZ9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.15■■■■■ 5.94
BicraF8VPZ9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC52.14■■■■■ 5.94
BicraF8VPZ9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC52.12■■■■■ 5.93
BicraF8VPZ9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.08■■■■■ 5.93
BicraF8VPZ9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.03■■■■■ 5.92
BicraF8VPZ9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.01■■■■■ 5.92
BicraF8VPZ9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC51.9■■■■■ 5.9
BicraF8VPZ9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.9■■■■■ 5.9
BicraF8VPZ9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.87■■■■■ 5.89
BicraF8VPZ9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC51.87■■■■■ 5.89
BicraF8VPZ9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC51.85■■■■■ 5.89
BicraF8VPZ9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC51.72■■■■■ 5.87
BicraF8VPZ9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
BicraF8VPZ9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.68■■■■■ 5.86
BicraF8VPZ9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC51.66■■■■■ 5.86
BicraF8VPZ9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.62■■■■■ 5.85
BicraF8VPZ9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC51.62■■■■■ 5.85
BicraF8VPZ9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC51.61■■■■■ 5.85
BicraF8VPZ9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.61■■■■■ 5.85
BicraF8VPZ9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC51.61■■■■■ 5.85
BicraF8VPZ9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC51.58■■■■■ 5.85
BicraF8VPZ9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.56■■■■■ 5.84
BicraF8VPZ9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC51.52■■■■■ 5.84
BicraF8VPZ9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.52■■■■■ 5.84
BicraF8VPZ9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC51.51■■■■■ 5.84
BicraF8VPZ9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.5■■■■■ 5.83
BicraF8VPZ9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC51.49■■■■■ 5.83
BicraF8VPZ9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
BicraF8VPZ9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.41■■■■■ 5.82
BicraF8VPZ9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
BicraF8VPZ9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.35■■■■■ 5.81
BicraF8VPZ9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.3■■■■■ 5.8
BicraF8VPZ9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC51.3■■■■■ 5.8
BicraF8VPZ9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
BicraF8VPZ9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.21■■■■■ 5.79
BicraF8VPZ9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC51.2■■■■■ 5.79
BicraF8VPZ9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
BicraF8VPZ9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC51.16■■■■■ 5.78
BicraF8VPZ9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
BicraF8VPZ9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC51.14■■■■■ 5.78
BicraF8VPZ9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.12■■■■■ 5.77
BicraF8VPZ9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
BicraF8VPZ9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC51.09■■■■■ 5.77
BicraF8VPZ9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.05■■■■■ 5.76
BicraF8VPZ9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.04■■■■■ 5.76
BicraF8VPZ9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC51.03■■■■■ 5.76
BicraF8VPZ9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC51.02■■■■■ 5.76
BicraF8VPZ9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC51.01■■■■■ 5.76
BicraF8VPZ9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
BicraF8VPZ9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC50.99■■■■■ 5.75
BicraF8VPZ9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC50.99■■■■■ 5.75
BicraF8VPZ9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC50.98■■■■■ 5.75
BicraF8VPZ9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.98■■■■■ 5.75
BicraF8VPZ9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
BicraF8VPZ9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC50.95■■■■■ 5.75
BicraF8VPZ9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
BicraF8VPZ9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
BicraF8VPZ9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC50.89■■■■■ 5.74
BicraF8VPZ9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.85■■■■■ 5.73
BicraF8VPZ9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.82■■■■■ 5.73
BicraF8VPZ9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC50.8■■■■■ 5.72
BicraF8VPZ9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC50.78■■■■■ 5.72
BicraF8VPZ9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
BicraF8VPZ9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC50.72■■■■■ 5.71
BicraF8VPZ9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC50.71■■■■■ 5.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms