Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Syngap1F6SEU4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Syngap1F6SEU4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Syngap1F6SEU4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Syngap1F6SEU4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Syngap1F6SEU4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Syngap1F6SEU4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Syngap1F6SEU4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Syngap1F6SEU4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Syngap1F6SEU4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Syngap1F6SEU4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Syngap1F6SEU4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Syngap1F6SEU4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Syngap1F6SEU4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Syngap1F6SEU4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Syngap1F6SEU4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Syngap1F6SEU4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Syngap1F6SEU4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Syngap1F6SEU4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Syngap1F6SEU4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Syngap1F6SEU4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Syngap1F6SEU4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Syngap1F6SEU4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Syngap1F6SEU4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Syngap1F6SEU4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Syngap1F6SEU4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Syngap1F6SEU4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Syngap1F6SEU4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Syngap1F6SEU4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Syngap1F6SEU4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Syngap1F6SEU4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Syngap1F6SEU4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Syngap1F6SEU4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Syngap1F6SEU4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Syngap1F6SEU4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Syngap1F6SEU4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Syngap1F6SEU4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Syngap1F6SEU4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Syngap1F6SEU4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Syngap1F6SEU4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Syngap1F6SEU4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Syngap1F6SEU4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Syngap1F6SEU4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Syngap1F6SEU4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Syngap1F6SEU4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Syngap1F6SEU4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Syngap1F6SEU4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Syngap1F6SEU4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Syngap1F6SEU4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Syngap1F6SEU4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Syngap1F6SEU4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Syngap1F6SEU4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Syngap1F6SEU4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Syngap1F6SEU4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Syngap1F6SEU4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Syngap1F6SEU4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Syngap1F6SEU4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Syngap1F6SEU4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Syngap1F6SEU4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Syngap1F6SEU4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Syngap1F6SEU4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Syngap1F6SEU4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Syngap1F6SEU4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Syngap1F6SEU4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Syngap1F6SEU4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Syngap1F6SEU4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Syngap1F6SEU4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Syngap1F6SEU4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Syngap1F6SEU4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Syngap1F6SEU4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Syngap1F6SEU4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Syngap1F6SEU4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Syngap1F6SEU4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Syngap1F6SEU4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Syngap1F6SEU4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Syngap1F6SEU4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Syngap1F6SEU4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Syngap1F6SEU4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Syngap1F6SEU4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Syngap1F6SEU4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Syngap1F6SEU4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Syngap1F6SEU4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Syngap1F6SEU4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Syngap1F6SEU4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Syngap1F6SEU4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Syngap1F6SEU4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Syngap1F6SEU4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Syngap1F6SEU4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Syngap1F6SEU4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Syngap1F6SEU4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Syngap1F6SEU4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Syngap1F6SEU4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Syngap1F6SEU4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Syngap1F6SEU4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Syngap1F6SEU4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Syngap1F6SEU4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Syngap1F6SEU4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Syngap1F6SEU4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Syngap1F6SEU4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Syngap1F6SEU4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms