Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cfap46E9Q2C0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cfap46E9Q2C0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cfap46E9Q2C0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cfap46E9Q2C0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cfap46E9Q2C0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cfap46E9Q2C0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cfap46E9Q2C0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cfap46E9Q2C0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cfap46E9Q2C0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cfap46E9Q2C0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cfap46E9Q2C0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cfap46E9Q2C0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cfap46E9Q2C0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cfap46E9Q2C0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cfap46E9Q2C0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cfap46E9Q2C0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cfap46E9Q2C0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cfap46E9Q2C0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfap46E9Q2C0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cfap46E9Q2C0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfap46E9Q2C0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cfap46E9Q2C0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfap46E9Q2C0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfap46E9Q2C0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfap46E9Q2C0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfap46E9Q2C0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfap46E9Q2C0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfap46E9Q2C0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfap46E9Q2C0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfap46E9Q2C0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Cfap46E9Q2C0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cfap46E9Q2C0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cfap46E9Q2C0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cfap46E9Q2C0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cfap46E9Q2C0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cfap46E9Q2C0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cfap46E9Q2C0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cfap46E9Q2C0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cfap46E9Q2C0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cfap46E9Q2C0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cfap46E9Q2C0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cfap46E9Q2C0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cfap46E9Q2C0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cfap46E9Q2C0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cfap46E9Q2C0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cfap46E9Q2C0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cfap46E9Q2C0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cfap46E9Q2C0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cfap46E9Q2C0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfap46E9Q2C0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfap46E9Q2C0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfap46E9Q2C0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfap46E9Q2C0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfap46E9Q2C0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfap46E9Q2C0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cfap46E9Q2C0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cfap46E9Q2C0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cfap46E9Q2C0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cfap46E9Q2C0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfap46E9Q2C0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cfap46E9Q2C0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cfap46E9Q2C0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cfap46E9Q2C0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cfap46E9Q2C0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cfap46E9Q2C0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cfap46E9Q2C0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cfap46E9Q2C0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cfap46E9Q2C0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cfap46E9Q2C0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cfap46E9Q2C0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfap46E9Q2C0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfap46E9Q2C0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cfap46E9Q2C0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cfap46E9Q2C0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cfap46E9Q2C0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cfap46E9Q2C0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cfap46E9Q2C0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfap46E9Q2C0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfap46E9Q2C0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap46E9Q2C0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap46E9Q2C0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap46E9Q2C0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfap46E9Q2C0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cfap46E9Q2C0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cfap46E9Q2C0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cfap46E9Q2C0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfap46E9Q2C0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfap46E9Q2C0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap46E9Q2C0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap46E9Q2C0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap46E9Q2C0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap46E9Q2C0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap46E9Q2C0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap46E9Q2C0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap46E9Q2C0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfap46E9Q2C0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap46E9Q2C0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap46E9Q2C0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap46E9Q2C0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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