Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3250E9Q1M3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3250E9Q1M3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3250E9Q1M3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3250E9Q1M3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3250E9Q1M3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3250E9Q1M3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3250E9Q1M3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm3250E9Q1M3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3250E9Q1M3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3250E9Q1M3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3250E9Q1M3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3250E9Q1M3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3250E9Q1M3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3250E9Q1M3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3250E9Q1M3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3250E9Q1M3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3250E9Q1M3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3250E9Q1M3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3250E9Q1M3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3250E9Q1M3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3250E9Q1M3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3250E9Q1M3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3250E9Q1M3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3250E9Q1M3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3250E9Q1M3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3250E9Q1M3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3250E9Q1M3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3250E9Q1M3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3250E9Q1M3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3250E9Q1M3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3250E9Q1M3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3250E9Q1M3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3250E9Q1M3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3250E9Q1M3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3250E9Q1M3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3250E9Q1M3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3250E9Q1M3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3250E9Q1M3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3250E9Q1M3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3250E9Q1M3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3250E9Q1M3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3250E9Q1M3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3250E9Q1M3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3250E9Q1M3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3250E9Q1M3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3250E9Q1M3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3250E9Q1M3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3250E9Q1M3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3250E9Q1M3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3250E9Q1M3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3250E9Q1M3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3250E9Q1M3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm3250E9Q1M3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3250E9Q1M3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3250E9Q1M3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3250E9Q1M3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3250E9Q1M3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3250E9Q1M3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3250E9Q1M3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3250E9Q1M3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3250E9Q1M3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3250E9Q1M3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3250E9Q1M3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3250E9Q1M3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3250E9Q1M3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3250E9Q1M3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3250E9Q1M3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3250E9Q1M3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3250E9Q1M3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3250E9Q1M3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3250E9Q1M3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3250E9Q1M3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3250E9Q1M3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3250E9Q1M3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3250E9Q1M3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3250E9Q1M3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3250E9Q1M3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3250E9Q1M3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3250E9Q1M3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3250E9Q1M3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3250E9Q1M3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3250E9Q1M3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3250E9Q1M3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3250E9Q1M3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3250E9Q1M3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3250E9Q1M3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3250E9Q1M3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3250E9Q1M3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3250E9Q1M3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3250E9Q1M3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3250E9Q1M3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3250E9Q1M3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3250E9Q1M3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3250E9Q1M3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3250E9Q1M3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3250E9Q1M3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3250E9Q1M3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3250E9Q1M3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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