Protein–RNA interactions for Protein: D2J0Y4

D7Ertd443e, Centrosomal protein C10orf90 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D7Ertd443eD2J0Y4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
D7Ertd443eD2J0Y4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
D7Ertd443eD2J0Y4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
D7Ertd443eD2J0Y4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
D7Ertd443eD2J0Y4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
D7Ertd443eD2J0Y4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
D7Ertd443eD2J0Y4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
D7Ertd443eD2J0Y4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
D7Ertd443eD2J0Y4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
D7Ertd443eD2J0Y4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
D7Ertd443eD2J0Y4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
D7Ertd443eD2J0Y4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
D7Ertd443eD2J0Y4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
D7Ertd443eD2J0Y4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
D7Ertd443eD2J0Y4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
D7Ertd443eD2J0Y4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
D7Ertd443eD2J0Y4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
D7Ertd443eD2J0Y4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
D7Ertd443eD2J0Y4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
D7Ertd443eD2J0Y4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
D7Ertd443eD2J0Y4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
D7Ertd443eD2J0Y4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
D7Ertd443eD2J0Y4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
D7Ertd443eD2J0Y4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
D7Ertd443eD2J0Y4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
D7Ertd443eD2J0Y4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
D7Ertd443eD2J0Y4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
D7Ertd443eD2J0Y4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
D7Ertd443eD2J0Y4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
D7Ertd443eD2J0Y4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
D7Ertd443eD2J0Y4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
D7Ertd443eD2J0Y4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
D7Ertd443eD2J0Y4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
D7Ertd443eD2J0Y4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
D7Ertd443eD2J0Y4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
D7Ertd443eD2J0Y4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
D7Ertd443eD2J0Y4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D7Ertd443eD2J0Y4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
D7Ertd443eD2J0Y4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
D7Ertd443eD2J0Y4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
D7Ertd443eD2J0Y4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
D7Ertd443eD2J0Y4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
D7Ertd443eD2J0Y4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
D7Ertd443eD2J0Y4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
D7Ertd443eD2J0Y4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
D7Ertd443eD2J0Y4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
D7Ertd443eD2J0Y4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
D7Ertd443eD2J0Y4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
D7Ertd443eD2J0Y4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
D7Ertd443eD2J0Y4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
D7Ertd443eD2J0Y4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
D7Ertd443eD2J0Y4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
D7Ertd443eD2J0Y4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
D7Ertd443eD2J0Y4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
D7Ertd443eD2J0Y4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
D7Ertd443eD2J0Y4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
D7Ertd443eD2J0Y4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
D7Ertd443eD2J0Y4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D7Ertd443eD2J0Y4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
D7Ertd443eD2J0Y4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D7Ertd443eD2J0Y4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D7Ertd443eD2J0Y4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
D7Ertd443eD2J0Y4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
D7Ertd443eD2J0Y4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
D7Ertd443eD2J0Y4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
D7Ertd443eD2J0Y4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
D7Ertd443eD2J0Y4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
D7Ertd443eD2J0Y4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
D7Ertd443eD2J0Y4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
D7Ertd443eD2J0Y4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
D7Ertd443eD2J0Y4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
D7Ertd443eD2J0Y4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
D7Ertd443eD2J0Y4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
D7Ertd443eD2J0Y4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
D7Ertd443eD2J0Y4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
D7Ertd443eD2J0Y4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
D7Ertd443eD2J0Y4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
D7Ertd443eD2J0Y4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
D7Ertd443eD2J0Y4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
D7Ertd443eD2J0Y4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
D7Ertd443eD2J0Y4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
D7Ertd443eD2J0Y4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
D7Ertd443eD2J0Y4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
D7Ertd443eD2J0Y4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D7Ertd443eD2J0Y4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D7Ertd443eD2J0Y4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D7Ertd443eD2J0Y4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
D7Ertd443eD2J0Y4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
D7Ertd443eD2J0Y4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
D7Ertd443eD2J0Y4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
D7Ertd443eD2J0Y4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
D7Ertd443eD2J0Y4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
D7Ertd443eD2J0Y4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D7Ertd443eD2J0Y4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D7Ertd443eD2J0Y4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
D7Ertd443eD2J0Y4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
D7Ertd443eD2J0Y4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D7Ertd443eD2J0Y4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D7Ertd443eD2J0Y4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
D7Ertd443eD2J0Y4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms