Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Uhrf1bp1lA2RSJ4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Uhrf1bp1lA2RSJ4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms