Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Svep1A2AVA0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Svep1A2AVA0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Svep1A2AVA0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Svep1A2AVA0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Svep1A2AVA0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Svep1A2AVA0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Svep1A2AVA0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Svep1A2AVA0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Svep1A2AVA0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Svep1A2AVA0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Svep1A2AVA0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Svep1A2AVA0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Svep1A2AVA0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Svep1A2AVA0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Svep1A2AVA0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Svep1A2AVA0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Svep1A2AVA0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Svep1A2AVA0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Svep1A2AVA0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Svep1A2AVA0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Svep1A2AVA0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Svep1A2AVA0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Svep1A2AVA0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Svep1A2AVA0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Svep1A2AVA0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Svep1A2AVA0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Svep1A2AVA0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Svep1A2AVA0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Svep1A2AVA0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Svep1A2AVA0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Svep1A2AVA0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Svep1A2AVA0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Svep1A2AVA0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Svep1A2AVA0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Svep1A2AVA0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Svep1A2AVA0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Svep1A2AVA0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Svep1A2AVA0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Svep1A2AVA0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Svep1A2AVA0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Svep1A2AVA0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Svep1A2AVA0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Svep1A2AVA0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Svep1A2AVA0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Svep1A2AVA0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Svep1A2AVA0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Svep1A2AVA0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Svep1A2AVA0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Svep1A2AVA0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Svep1A2AVA0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Svep1A2AVA0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Svep1A2AVA0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Svep1A2AVA0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Svep1A2AVA0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Svep1A2AVA0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Svep1A2AVA0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Svep1A2AVA0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Svep1A2AVA0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Svep1A2AVA0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Svep1A2AVA0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Svep1A2AVA0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Svep1A2AVA0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Svep1A2AVA0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Svep1A2AVA0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Svep1A2AVA0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Svep1A2AVA0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Svep1A2AVA0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Svep1A2AVA0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Svep1A2AVA0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Svep1A2AVA0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Svep1A2AVA0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Svep1A2AVA0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Svep1A2AVA0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Svep1A2AVA0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Svep1A2AVA0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Svep1A2AVA0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Svep1A2AVA0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Svep1A2AVA0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Svep1A2AVA0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Svep1A2AVA0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Svep1A2AVA0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Svep1A2AVA0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Svep1A2AVA0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Svep1A2AVA0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Svep1A2AVA0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Svep1A2AVA0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Svep1A2AVA0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Svep1A2AVA0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Svep1A2AVA0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Svep1A2AVA0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Svep1A2AVA0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Svep1A2AVA0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Svep1A2AVA0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Svep1A2AVA0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Svep1A2AVA0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Svep1A2AVA0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Svep1A2AVA0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Svep1A2AVA0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Svep1A2AVA0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms