Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkraQ9WTX2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkraQ9WTX2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms