Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krtap5-3Q9D226 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krtap5-3Q9D226 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krtap5-3Q9D226 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krtap5-3Q9D226 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krtap5-3Q9D226 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krtap5-3Q9D226 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krtap5-3Q9D226 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krtap5-3Q9D226 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krtap5-3Q9D226 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krtap5-3Q9D226 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krtap5-3Q9D226 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krtap5-3Q9D226 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krtap5-3Q9D226 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Krtap5-3Q9D226 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Krtap5-3Q9D226 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krtap5-3Q9D226 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krtap5-3Q9D226 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krtap5-3Q9D226 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krtap5-3Q9D226 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Krtap5-3Q9D226 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krtap5-3Q9D226 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krtap5-3Q9D226 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krtap5-3Q9D226 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms