Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tubb2bQ9CWF2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubb2bQ9CWF2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms