Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt79Q8VED5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt79Q8VED5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt79Q8VED5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt79Q8VED5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt79Q8VED5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt79Q8VED5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt79Q8VED5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt79Q8VED5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt79Q8VED5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt79Q8VED5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt79Q8VED5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt79Q8VED5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt79Q8VED5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt79Q8VED5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt79Q8VED5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt79Q8VED5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt79Q8VED5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt79Q8VED5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt79Q8VED5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms