Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh2d5Q8JZW5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh2d5Q8JZW5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms