Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc30Q8BVF4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc30Q8BVF4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms