Protein–RNA interactions for Protein: P89113

DDR2, Protein DDR2, yeast

Predictions only

Length 61 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	P89113	FOL1	YNL256W	2475 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	BUD9	YGR041W	1644 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	MNS1	YJR131W	1650 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	GEP3	YOR205C	1671 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	RML2	YEL050C	1182 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	ENV7	YPL236C	1095 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	UBC4	YBR082C	447 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	YPR195C	YPR195C	330 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	NRD1	YNL251C	1728 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	CST6	YIL036W	1764 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	PUF3	YLL013C	2640 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	PRS2	YER099C	957 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	PGA3	YML125C	939 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	PIN2	YOR104W	849 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	STE50	YCL032W	1041 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	RPT2	YDL007W	1314 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	SUB2	YDL084W	1341 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	ORC5	YNL261W	1440 nt		3.59	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	GPT2	YKR067W	2232 nt		3.59	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	RAT1	YOR048C	3021 nt		3.59	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	HRP1	YOL123W	1605 nt		3.59	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	NQM1	YGR043C	1002 nt		3.58	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	YHC3	YJL059W	1227 nt		3.58	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	YLR184W	YLR184W	348 nt		3.58	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	GPM3	YOL056W	912 nt		3.58	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	OXP1	YKL215C	3861 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	GCS1	YDL226C	1059 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	YDR154C	YDR154C	351 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	VHS1	YDR247W	1386 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	DFM1	YDR411C	1026 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	BRF1	YGR246C	1791 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	MAL11	YGR289C	1851 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	RPS19B	YNL302C	435 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	YNR048W	YNR048W	1182 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	DED81	YHR019C	1665 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	ATE1	YGL017W	1512 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	SHM1	YBR263W	1473 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	YCR047W-A	YCR047W-A	207 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	MTW1	YAL034W-A	870 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	IMD1	YAR073W	1212 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	RPA49	YNL248C	1248 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	FRE3	YOR381W	2136 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	SHE10	YGL228W	1734 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	YMR027W	YMR027W	1413 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	HES1	YOR237W	1305 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	SIT4	YDL047W	936 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	POR2	YIL114C	846 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	YLR126C	YLR126C	756 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	ODC2	YOR222W	924 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	SSY5	YJL156C	2100 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	PAN1	YIR006C	4443 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	RPT1	YKL145W	1404 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	ALT1	YLR089C	1779 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	LYS21	YDL131W	1323 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	HXT15	YDL245C	1704 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	HXT16	YJR158W	1704 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	TRP5	YGL026C	2124 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	PRE3	YJL001W	648 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	SPO7	YAL009W	780 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	SNO4	YMR322C	714 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	BUB3	YOR026W	1026 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	HSP33	YOR391C	714 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	HSP32	YPL280W	714 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	QDR1	YIL120W	1692 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	LDB19	YOR322C	2457 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	OCA5	YHL029C	2040 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	UBA1	YKL210W	3075 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	KIP2	YPL155C	2121 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	AIM3	YBR108W	2844 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	DPH2	YKL191W	1605 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	YDL121C	YDL121C	450 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	YDL144C	YDL144C	1071 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	GAL83	YER027C	1254 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	MND2	YIR025W	1107 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	MPM1	YJL066C	759 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	ECM19	YLR390W	339 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	LEM3	YNL323W	1245 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	CWC27	YPL064C	906 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	SYG1	YIL047C	2709 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	CRZ1	YNL027W	2037 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DDR2	P89113	QRI1	YDL103C	1434 nt		3.53	□□□□□ -1.85
DDR2	P89113	BPL1	YDL141W	2073 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DDR2	P89113	COX26	YDR119W-A	201 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DDR2	P89113	DPH5	YLR172C	903 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DDR2	P89113	TFS1	YLR178C	660 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DDR2	P89113	YOR024W	YOR024W	324 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DDR2	P89113	COX11	YPL132W	903 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DDR2	P89113	YEN1	YER041W	2280 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DDR2	P89113	SLT2	YHR030C	1455 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DDR2	P89113	GPA1	YHR005C	1419 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DDR2	P89113	ULA1	YPL003W	1389 nt		3.51	□□□□□ -1.85
DDR2	P89113	PUS1	YPL212C	1635 nt		3.51	□□□□□ -1.85
DDR2	P89113	CBP4	YGR174C	513 nt		3.5	□□□□□ -1.85
DDR2	P89113	YJL107C	YJL107C	1164 nt		3.5	□□□□□ -1.85
DDR2	P89113	YLL059C	YLL059C	507 nt		3.5	□□□□□ -1.85
DDR2	P89113	YNL017C	YNL017C	339 nt		3.5	□□□□□ -1.85
DDR2	P89113	SCO1	YBR037C	888 nt		3.5	□□□□□ -1.85
DDR2	P89113	BIT2	YBR270C	1638 nt		3.5	□□□□□ -1.85
DDR2	P89113	DAK1	YML070W	1755 nt		3.5	□□□□□ -1.85
DDR2	P89113	PDI1	YCL043C	1569 nt		3.5	□□□□□ -1.85

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