Protein–RNA interactions for Protein: O88708

Orc4, Origin recognition complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc4O88708 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Orc4O88708 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Orc4O88708 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Orc4O88708 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Orc4O88708 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Orc4O88708 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Orc4O88708 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Orc4O88708 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Orc4O88708 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Orc4O88708 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Orc4O88708 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Orc4O88708 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Orc4O88708 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Orc4O88708 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Orc4O88708 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Orc4O88708 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Orc4O88708 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Orc4O88708 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Orc4O88708 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Orc4O88708 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Orc4O88708 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms