Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r194J3JS27 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r194J3JS27 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r194J3JS27 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r194J3JS27 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r194J3JS27 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r194J3JS27 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r194J3JS27 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r194J3JS27 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms