Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r238E9Q373 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r238E9Q373 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms